Oxford Nanopore测序数据惊艳首发!

武汉未来组(NextOmics)作为国内三代测序技术应用的开拓者,自2011年起一直致力于将领先的技术提供给关注前沿科学的合作伙伴。我们是中国PacBio测序服务供应商,是亚太区首批PacBio Sequel测序中心,凭借5年多的技术积累,成为了世界领先的三代测序中心。

今天,我们又将提供Oxford Nanopore (ONT) 数据首发,为大家引荐突破测序界“摩尔定律”的Oxford Nanopore测序技术。

【未来组采用人血源DNA,构建>10kb文库,于Nanopore MinION测1个flowcell,对下机reads进行质控统计,并与参考序列进行比对。】

高产出 高质量

单个flowcell产出约2.5G,与文献中使用Nanopore MinION测序组装人类参考基因组时的平均产出相当:~2.3Gb[1](39个flowcell共产出91.2Gb),并且其中高质量reads比例>80%。

超长读长

随后评估reads读长分布,平均读长~13.5kb,long reads最长达137kb,高于文献中的测序数据[1](Mean read length ~8.6kb)。

与参考基因组比对mapping率高

之后再评估测序数据的准确度,将reads与参考基因组GRCh37比对,mapping率高,符合预期。

简评 

记得今年早期,向稳(基云惠康创始人)在一篇微信文章中就提出,中国哪家测序公司会首先推出Oxford Nanopore的测序服务?我们今天算是给出了一个正式的答复。

三代测序是武汉未来组从2012年开始,就确定的差异化发展的战略。在2013年3月11日,正式推出三代测序(PacBio平台)服务以后,武汉未来组就一直不遗余力的推动三代测序在各个领域的应用,从一开始是在线粒体、叶绿体、细菌的基因组组装、表观修饰分析,逐步过渡动植物基因组的组装、人类基因组的组装、全长转录组等领域,武汉未来组一直走在了探索的前沿。今天,我们推出三代测序的又一个新平台,Oxford Nanopore,这对于我们来说,是一个新的里程碑。坦率的说,是否中国首家推出Oxford Nanopore测序服务,对于武汉未来组来讲,已经没有实质性的意义,但是,对于一个追求技术极限的团队来说,不走在技术的最前沿,就是一种耻辱,是我们不能接受的。

今天,我们公开的数据结果,仍然是很初步的数据,Oxford Nanopore平台仍然是一个早期应用的平台,还有很多不完美的地方。但是,我们相信,这条道路通向的,一定是一个崭新的世界!

Hello,未来!

Hello,Next-generation Omics !

参考文献

[1] MJain, S Koren, J Quick, et al. Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads. bioRxiv.2017

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