先睹为快!未来组Bionano DLS实测数据首发

DLS标记技术(Direct Label and Stain)在2018年年初由Bionano genomics公司正式推出,相较于传统的NLRS技术,其优势在于不对基因组DNA双链进行切刻、不产生任何物理损伤即可完成标记,避免了之前NLRS标记技术中由于DNA正负链切刻位置重叠而造成的双链DNA片段的断裂,提高了基因组组装的精确度和连续性,能够组装染色体臂长度和整条染色体长度的图谱,还可以提高基因组结构变异检测的灵敏度。下面将与大家一起分享武汉未来组多个Bionano DLS的实际项目经验。
未来组Bionano DLS实测数据展示

武汉未来组基因组测序中心拥有新型Bionano Saphyr平台,已完成Bionano测序分析项目上百个,具有丰富的实际操作经验和超强的数据分析能力。目前基于DLS标记技术,实现了高效率、高质量的数据产出(Figure 1)。

Figure 1未来组某植物Bionano实测数据统计

未来组Bionano DLS辅助基因组组装案例展示

未来组成功在多个基因组组装项目中应用Bionano数据辅助提升基因组组装质量,辅助基因组组装提升能力可达百倍级别。如某植物基因组,辅助组装前contig N50为0.27Mb,以53X的有效覆盖数据辅助组装以后,scaffold N50达到38.9Mb,提高了144倍(Table 1)。

Table 1未来组Bionano DLS辅助组装项目案例

新技术DLS的推出,使得Bionano可以在基因组研究领域中得到更广泛的应用。在基因组结构变异研究方面,DLS标记技术超高的灵敏度和超强分辨率能够更加特异性的揭示基因组真实结构;在基因组图谱研究方面,DLS标记技术帮助研究者更快速、更高效地提高基因组组装的准确性和完整性。Bionano DLS将成为世界各国基因组研究者不可缺少的研究工具,未来组积累的丰富项目经验为您的基因组研究保驾护航。

附:近两年发表的三代+Bionano辅助组装基因组高分文章(“*”为未来组参与合作项目文章)

0 回复

发表评论

想参加讨论吗?
请尽情讨论吧!

发表评论

邮箱地址不会被公开。 必填项已用*标注