近年来,基于二代测序技术(NGS)的全基因组测序(WGS)和全外显子测序(WES)运用越来越广泛,在一定程度上提高了遗传病的诊断率。然而,受限于其技术特点(NGS读长较短、具有GC偏好性),通过WES或WGS的方法仍有大量遗传病患者未被诊断。希望组作为三代测序精准医疗公司,建立了以三代全基因组测序(ONT-WGS)、二代全外显子测序(WES)以及一代测序结果验证为核心的遗传病基因检测整体解决方案,可最大程度提高致病变异的检出率,让更多的遗传病患者得到确诊。

该检测方法具有以下特点:

同时进行基于长读长测序平台的ONT-WGS和基于二代测序平台的WES,不仅可以有效检测编码区的变异,还可获得内含子区域、基因调控区及基因间变异信息

精准识别染色体平衡易位、倒位等结构变异的断点信息,为胚胎植入前遗传学诊断(PGD)提供重要参考信息

可直接获得目标区域的甲基化修饰信息

可准确识别短串联重复序列

检测流程

产品优势

全面高效的检测方案

结合多种测序技术,全面覆盖多种变异类型,提高疾病诊断率

完善的数据分析流程

拥有与测序平台相配套的生物信息分析系统,能够高效有效地进行数据分析与挖掘

临床与科研结合

先进的三代测序平台支撑,雄厚的研发实力,满足临床和科研的双重需求

专业的报告解读

深度基因组数据解读,规范的报告解读流程,高效精准地发现致病变异

强大的专家团队

拥有一支由医学专家、生物信息学专家、遗传咨询专业人员、临床医生组成的强大专家团队,可提供优质专业的遗传检测与咨询服务

适用人群

  • 具有明确的遗传病家族史的患者
  • 有非典型性疾病特征的患者,且高度怀疑与遗传有关
  • 已做过其他基因检测,但未查明病因的患者

服务流程

案例分享

案例分享

患者为一名12岁的男孩,临床表现症状为腹部隆凸、肝脾肿大、臀部和手腕表现为骨质酥松,转氨酶和其他生化水平均表现异常,初步判断该患儿可能患有糖原累计病la型(GSD-la)。

  • WES检测

对患者进行全外显子组测序,结果显示,患者的G6PC基因上存在一个纯合错义突变(c.326G>A),该位点在蛋白序列中高度保守。根据OMIM记载,染色体17q21上编码葡萄糖-6-磷酸酶的G6PC基因上的纯合或复合杂合突变可能引起GSD-Ia,遗传模式为常染色体隐性遗传。结合家族史问询,推测患者的父母皆为G6PC基因位点变异携带者,患者为纯合变异。

       Fig 1. 患者家系图

随后进行了一代结果验证,但验证结果却与推测不符,只有母亲携带该位点的杂合变异,父亲未携带变异。

 Fig 2. 一代测序验证结果

  • ONT-WGS

由于WES无法解释致病变异以及与遗传模式的冲突,随后对患者进行了三代全基因组测序,结果在患者G6PC基因的一个等位基因上检测到长达7Kb的缺失突变:chr17 g.41049904_41057049del7146 (GRCh37),并有4条Nanopore reads能对该缺失突变进行支持。该缺失变异覆盖了G6PC基因的5’调节区域、外显子1、内含子1、外显子2、内含子2的一部分,共计7125 bp,最终导致了基因功能丧失(loss of function)。通过定量QPCR和凝胶电泳也很好地验证了这段缺失变异。

  Fig 3. ONT-WGS检测到的缺失区域

  Fig 4. QPCR验证结果

综合ONT-WGS和WES的检测结果,该患者携带来自母亲的错义突变(c.326G>A)和来自父亲的缺失变异(chr17 g.41049879_41057003del7125),最终导致疾病的发生。