空间转录组（Spatial Transcriptomics）是测量完整组织切片的总mRNA，将总mRNA的空间信息与形态学内容相结合，并绘制所有基因表达发生的位置，获得生物过程复杂而完整的基因表达图谱。在确定不同细胞群的同时保留空间位置，为细胞功能、表型和组织微环境中位置的关系提供了重要信息。可揭示精细生理区域中激活的信号通路，完成分子特征驱动生物特征的机制解析。希望组提供基于NanoString平台的空间转录组分析服务，具有极高的灵敏度、精确度和重复性。该技术无需酶促反应，无需反转录，也不需要PCR 扩增，可进一步减少误差的产生，因此nCounter 在表达谱定量分析领域具有无可比拟的优势。

实验内容

1. 荧光编码探针与目标分子杂交

荧光编码探针具有两个部份

• 报告探针(Reporter Probe)是一段带有靶分子特异性的50 mer 核酸序列并偶联不同荧光颜色排列组合（CodeSet）而成的探针，为主要的检测信号来源。荧光探针可实现800种不同排列组合，以达到区分不同靶分子的效应。

• 捕获探针（Capture Probe）:是一段带有有靶分子特异性的50 mer 核酸序列并偶联生物素的探针， 其目的是使探针捕获靶分子并固定在由亲和素包被的Cartridge上。

• 分子杂交：此过程是在EP管内将报告探针，捕获探针与靶分子混合物（样本）进行杂交的过程，杂交后在液相中形成各种靶分子特异性的复合物(Target-Probe Complex)。

2. 靶分子特异性复合物的纯化与固定

杂交完成后, 将样品送进全自动Prep Station移除剩余为杂交的探针，并且将纯化的靶分子复合物与包被有亲和素的Cartridge进行接合（通过生物素-亲和素结合反应），并通电使其皆朝同一个方向排列。

3. 信号采集与定量

将cartridges移动到 nCounter Digital Analyzer进行信号数据采集 计数在Cartridge表面上对应每一种特异性荧光编码探针的数量（一个分子=一个计数）并且将其列表标识，进行最终的定量统计，来确定反应系统内所有目标分子的个数。

nanoString nCounter计技术可对同一样本实现DNA，RNA和蛋白质的多组学共检测。可实现30种蛋白和770种RNA的表达谱共分析。消除不同分析间的差异，真正意义上实现3维组学分析。