
2019年12月,武汉出现不明原因肺炎,2020-01-12日,世界卫生组织正式将造成此次疫情的新型冠状病毒命名为“2019新型冠状病毒(2019-nCoV)”。近一个月来肺炎疫情发展迅猛,截至2020-01-30 24:00 全国已确诊患者9692例,疑似患者15238例,而作为疫区核心的武汉已有2639名确诊病例(数据来源:人民日报)。疫情的蔓延,让我们心急如焚,作为国内首家基于第三代测序技术的精准医疗公司,尤其是作为一家武汉本地企业,我们也热切的期待能贡献自己的一点点微薄的力量。公司在疫情爆发期间动员了核心研发团队,紧急攻关,开展基于第三代单分子新诊断技术的研发。疫情爆发之后,国内众多精准医疗同行纷纷紧急动员,彻夜奋战,研发出各种基于RT-PCR(和胶体金试纸)的检测技术以及产品,大大缓解了疫情初期新冠状病毒检测通量的压力,对新冠状病毒的传播和控制做出卓越的行业贡献。我们和所有同行一样心系人民的健康,同仇敌忾,团结奋战,共抗病毒。打好病毒歼灭战,不仅需要对已知病毒进行的检测,更重要的是从源头进行防控,这包括对病毒演化和变异以及对其他已知和未知的致病病毒和细菌进行机动和实时的监控和研究。这通常是疫情战役最容易忽视和遗漏的一环。为此,我们的研究团队充分利用第三代单分子测序技术的优势,将重心放在以下几点:1. 病毒的实时检测和分析2. 利用5G技术支持临时隔离区域或者机动实验室进行云计算检测和分析3. 开发基于全长基因组的病毒演化和变异检测技术
截止2020-01-30日,我们终于完成了基于纳米孔测序技术的新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸全长检测试剂盒,以及基于纳米孔测序技术的宏基因组病原体检测方法。该试剂盒采用多重PCR对病原体核酸进行扩增后使用纳米孔测序仪进行测序,将得到的核酸序列与已知病原体序列对照确定病原体类型。纳米孔测序技术克服了传统NGS测序平台对样本制备、场地要求、运行时间长等限制性特点,具备实时、长读长、运行时间短、文库构建简单等优势。宏基因组病原体检测方法能够对快速演化的病原体以及其他未知的病原体进行检测。
我们和华为5G和华为云团队一起完成了实时机动的测序数据的上云传输和计算实验,能够确保在没有固定IT基础设施的临时区域或缺少有线网络和本地计算资源的地点能够通过无线网络进行病原体的检测和分析。
目前,新冠状病毒防控已经处于非常关键的时期,除了要快速、及时、高效的对疑似病例进行确诊以外,一个不容忽视的防控方向是进行病毒演化和变异的监控,希望组新试剂盒和宏基因组检测技术的推出,可以在疫情防控的关键阶段,提供非常重要、关键的技术支持。
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