2024年度自然指数榜单公布:希望组再度上榜!

近日,Nature Index官网发布了2024自然指数年度榜单(统计自2023年1月1日至2023年12月31日),希望组再度登榜,在大陆的生命科学领域中的测序企业排行榜中名列前茅。排行榜显示,希望组旗下品牌GrandOmics(希望组)和NextOmics(未来组)分别位列第17名和84名;数据合并后,希望组2023年计入自然指数的总Share为0.62,再次进入基因测序行业前3名

希望组自成立以来一直深耕于长读长测序领域,凭借雄厚的技术积累与合作伙伴的充分信任,在基础科研领域不断有重大科研成果的产出。

2023年希望组共合作发表文章50+篇,总影响因子800+,其中包含Cell、Science、Nature Genetic、Nature Communications等高质量期刊,涵盖基因组、泛基因组、群体基因组、单细胞以及转录组等研究领域。下面让我们一起来回顾一下希望组2023年被收录到自然指数的几篇重要文章吧。

1.Cell :48Gb南极磷虾超大基因组参考序列发布

2023年3月2日,希望组与中国水产科学研究院黄海水产研究所合作在国际顶级期刊Cell (IF=66.85)上发表“The enormous repetitive Antarctic krill genome reveals environmental adaptations and population insights”的研究论文,揭示了南极磷虾适应南大洋的基因组基础,并为未来的南极研究提供了宝贵的资源。研究团队利用PacBio、Hi-C结合短读长对南极磷虾进行测序,使用NextDenovo v2.30 (https://github.com/Nextomics/NextDenovo)组装了48.01Gb的基因组,这是迄今为止报道的最大的动物基因组组装。

(解读链接:署名文章 | Cell!NextDenovo助力破译迄今最大动物基因组—48Gb南极磷虾参考序列

2.Cell :大规模蛇基因组分析以解析脊椎动物的发育

2023年6月19日,希望组与中国科学院成都生物研究所李家堂团队在Cell (IF=64.5)上发表“Large-scale snake genome analyses provide insights into vertebrate development”的研究论文,该论文基于大规模多组学技术与基因编辑等研究手段,全面揭示了蛇类起源及特有表型演化的遗传机制,对理解脊椎动物演化历史具有重要意义。

(解读链接:项目文章 | Cell!李家堂团队揭示蛇类的起源与演化机制

3.Science :系统基因组学分析对灵长类演化进程提供见解

2023年6月2日,希望组与浙江大学生命演化研究中心张国捷教授团队联合昆明动物研究所吴东东教授团队、西北大学齐晓光教授团队等在Science (IF=56.9)上发表“Phylogenomic analyses provide insights into primate evolution”的研究论文,该研究对14科38属的50个灵长类物种进行分析,揭示了基因组重排和基因进化的异质性,发现不同谱系中处于正向选择下的数千个基因在神经、骨骼和消化系统中发挥作用。该研究还揭示了许多关键的基因组变异发生在类人猿下目祖先节点,并且可能对其适应性辐射和人类的进化产生影响。

4.Nature Genetics :玉米T2T基因组组装

2023年6月15日,希望组与中国农业大学国家玉米改良中心、玉米生物育种全国重点实验室赖锦盛教授团队以题为“A complete telomere-to-telomere assembly of the maize genome”在Nature Genetics(IF=30.8)上在线发表了玉米全基因组所有染色体端粒到端粒完整无间隙组装结果,在复杂动植物基因组中第一个实现真正意义上的全基因组完整无间隙组装。该研究是复杂基因组组装领域工程技术研究的重大突破,攻克了复杂动植物基因组组装的最后一道难题,是基因组组装和基因组学研究的一个重要里程碑。

(解读链接:署名文章 | Nature Genetics!希望组携手赖锦盛教授团队再创新里程—大型真核生物玉米T2T无间隙基因组

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