未来组全国巡讲

未来组全国巡讲

基于三代测序的动植物基因组及转录组学最新研究进展

近年来,PacBio SMRT 技术因其长读长、无偏好性等优势逐步被广大研究人员所接受,应用日趋广泛,其在大型动植物基因组和全长转录组等方面的研究成果近期爆发性地产出,例如四倍体藜麦硅藻山羊等基因组发表在Nature、Nature Genetics,以及高粱玉米矮牵牛等数十篇全长转录组文献陆续见刊,不断指引着组学研究的潮流。

未来组作为三代测序服务供应商,长期致力于前沿组学研究技术的推广及应用,2016年已搭建三代测序中心,为合作伙伴提供专业和优质的服务。

2017年第二季度,未来组将进行全国巡讲,为相关领域研究人员带来“基于三代测序的动植物基因组及转录组学最新研究进展”,覆盖从课题思路,项目执行及文章撰写全过程,不论是创新点还是重难点,您都将从未来组巡讲中获得答案。

以下为巡讲详细信息:

区 域

单  位

地  点

时  间

华中

中国科学院水生生物研究所水生所标本馆506

4月18日
周二上午9:30

中国农业科学院油料作物研究所

油料所二楼会议室

4月18日
周二下午14:30

华中农业大学

华中农业大学植物科学技术学院主楼315A

4月19日
周三上午10:00

河南农业大学

一号楼二楼学术报告厅

4月20日
周四上午9:30

河南省农业科学院

综合楼八楼会议室

4月20日
周四下午15:00

华北

中国农业大学

玉米中心112会议室

4月24日
周一下午15:00

中国农业科学院生物技术研究所

生物所216会议室

4月25日
周二下午14:30

首都师范大学

理科楼418

4月25日
周二晚上19:00

北京市农林科学院

综合楼二楼会议室

4月26日
周三上午10:00

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

畜禽改良中心一楼视频会议室南109

4月26日
周三下午14:30

北京中医药大学

望京校区东12较

4月27日
周四上午9:30

北京林业大学

实验楼407

4月27日
周四下午14:30

中国林业科学研究院

新森保楼小会议室

4月28日
周五上午9:30

华东

上海辰山植物园辰山科研中心二楼报告厅5月3日
周三上午10:00

上海海洋大学

水产生命学院A211

5月3日
周三下午15:00

上海交通大学

农业与生物技术学院 3-101

5月4日
周四上午10:00

南京农业大学

生物技术楼A3003

5月5日
周五上午10:00

南京林业大学

生物技术大楼61002

5月5日
周五下午15:00

浙江大学农生环楼c栋912

5月8日
周一上午10:00

安徽农业大学

国重楼111室

5月10日
周三上午10:00

南昌大学

南昌大学理科生命大楼A429

5月11日
周四下午15:00

江西农业大学

拾禄楼4楼报告厅

5月12日
周五上午10:00

浙江农林大学

东湖校区智能实验楼二楼大会议室

5月17日
周三下午14:00
云南云南大学校本部西楼313

5月15日
周一下午14:00

中国科学院昆明分院

西南生物多样性实验室楼1-24

5月16日
周二上午9:30

中国科学院昆明植物研究所

种质资源库4025月16日
周二下午14:30

中国科学院昆明动物研究所

主楼3-27

5月17日
周三下午14:30

中国科学院昆明植物研究所南楼4楼会议室

5月18日
周四上午9:30

福建

福建农林大学

海峡联合研究院
基因组与生物技术研究中心
(下安实验1号楼)5楼报告厅

5月24日
周三下午14:30

厦门大学环境与生态学院金泉楼A 239 会议室

5月25日
周四下午14:30

未来组三代测序中心启动仪式

3月11日下午,希望组&未来组三代测序平台启动仪式在北京总部盛大举行。本次仪式可谓高朋满座,大咖云集。来自科研领域、医疗领域以及媒体界等几十位嘉宾出席了启动仪式,共同见证这一盛事。

本次启动仪式于北京时间3月11日14点,在希望组&未来组北京总部隆重拉开帷幕。活动邀请了热心肠道联合创始人热心肠先生–蓝灿辉先生作为嘉宾主持人。

图:蓝灿辉先生

图:王文礼先生

仪式开始,由中关村生命科学园总经理王文礼先生代表中关村生命科学园,向希望组&未来组三代测序平台启动仪式致辞。

王总表示现代生物技术和新医药产业被喻为新世纪永远成长的“钻石产业”,成为当今各国激烈竞争、势在必夺的战略制高点。希望组作为三代测序精准医疗公司入驻园区,已成功搭建了三代测序技术平台,必将推动生命园区的医疗创新步入新台阶,将为生命园区的发展注入更多的新鲜血液,将会带动整个园区在生物技术、基因检测领域谱写出新的新篇章。

随后PacBio创始人及CTO Stephen Turner先生风趣幽默的讲述了PacBio的创业历史以及Sequel的发展历程,并介绍了三代测序在科研和医学领域应用的广阔前景。

图:Stephen Turner先生

图:张涛先生

基因集团董事局主席张涛先生发表致辞,向希望组&未来组表示热烈祝贺,张总表示本次启动仪式是在测序发展史上的重要里程碑,不仅对希望组&未来组至关重要,对基因公司及PacBio公司也至关重要。基因公司作为希望组&未来组供应商,希望今后能继续为希望组&未来组提供更好的服务,为基因测序做出重要的贡献。

图:黄尚志教授

本次活动还邀请了北京协和医院医学遗传学教授,中国遗传病及罕见病领域的专家—黄尚志老师,黄老师提出目前仍有很多以往的检测技术无法解决的复杂序列问题,导致很多疾病无法在分子水平上得到明确的诊断。期待希望组&未来组团队能借助三代测序平台超长读长的优势填补这块技术空白。

图:汪德鹏先生

仪式最后,希望组&未来组CEO汪德鹏先生向在场嘉宾简单介绍了建立未来组及希望组的契机及历程,同时展示了所取得的重要进展:参与发表了“华夏一号”—中国第一个参考序列级别的黄种人基因组近完成图,并参与相关国家、国际标准的制定;建立了与包括道培医疗集团在内多家大型医院的三代测序精准医疗战略合作;开发了低覆盖深度全基因组三代测序检出结构变异的产品。并表示将不负众望,带领团队持续创新,并逐步将科研服务方面的领先优势迅速转化为极具临床价值的核心竞争力。

活动最后以PacBio公司亚太区总裁Ram Laxman 先生向希望组授牌—“三代测序遗传病检测公司”为尾声,启动仪式顺利结束。此次活动标志着希望组&未来组步入了一个新的阶段。

寄语:

继未来组3台Sequel测序仪正常运行数月后,希望组实验中心的3台Sequel测序仪也安装调试完成,并实现了稳定的高数据产出。这样6台PacBio Sequel测序仪已全数到位。超长的读长,平均读长达10kb以上,每天可产出超60G数据,月均产出可高达2T。标志着希望组&未来组成为迄今Sequel数据产出中心

3+3 Sequel已到位,三代测序中心

未来组 6台PacBio Sequel 测序仪已全数到位。
超长的读长,6倍的通量,
月均产出将高达2T

武汉未来组于2016年订购了6台最新PacBio Sequel测序仪,其中三台位于武汉研发中心,另外三台位于未来组北京实验室,现均已通过调试,正持续高通量产出。

测序仪是测序技术的核心武器,一个现代测序中心对测序仪机种和机型的选择,事关命运,靠的是理念与远见,调查与预测(《基因组学》,杨焕明)。

2016年,未来组在同行业火拼X10时,已出手引进了PacBio Sequel测序仪,并率先完成Sequel平台试剂升级和测试,目前正平稳运行,为各位客户保质保量产出数据,那ATGC谱写出的是耳边不断跳动的音符。

未来组基于PacBio SMRT测序平台,积累大量的大基因组组装经验和创新,解决了超大基因组组装、多倍体组装难题,通过搭建Sequel测序平台和天河2号快速组装平台,将会大幅度缩短项目交付周期。2017年,未来组期待与您一起制定基因组测序计划。

未来组再次助阵PAG会议,这次我们会带去什么?

第25届国际动植物组基因组学大会(Plant & Animal Genome Conference,PAG)将于2017年1月14日-18日在美国加州圣地亚哥Town & Country会议中心举行。未来组诚邀您参与此次盛会,莅临未来组展位329,共同探讨动植物基因组学之未来新思路!

PAG会议是知名的基因组学盛会,专家们汇集一堂,报告、研讨模式生物、畜禽、水生生物、作物、微生物等各物种领域的基因组学进展,内容涉猎广泛深入,是动植物基因组学领域最高水平的国际会议。由于每年PAG会议都会有一系列新的课题进展和研究方法的发布,已经成为动植物基因组学领域的学者们最为关注的国际盛会之一。

在刚过去的2016年里,已有七十余种新的动植物基因组以SCI论文形式发表,其中约有1/4运用了第三代PacBio测序技术,如经PacBio测序组装得到的高质量大猩猩Susie基因组荣登了Science封面(点击了解详情),同时,基于PacBio测序的组装新算法也陆续推陈出新,例如NextSVFalcon-Unzip等生物信息分析软件的推出,解决了基因组学研究中结构变异、复杂二倍体基因组的单倍体定相等难题。相信在本次PAG会议上,将会有更多基于PacBio测序的动植物基因组的研究成果发布。

作为中国第三代测序服务的著名品牌,未来组将继续参展2017年PAG会议,本次未来组将会给大家带来什么?

未来组新购5台最新的Sequel测序平台, 此次盛会上将为大家展示Sequel平台平稳高通量运行的数据产出情况,以及多年积累的动植物基因组学的项目经验。未来组将继续推动基于PacBio测序的动植物大基因组研究的Super solution,包括超大基因组(大于15G),天河二号超级计算机群,分享第一个基于三代测序的亚洲人参考基因组“华夏一号”的成功组装经验。以及全长转录组、表观组学等贯穿多组学的Total solutions,敬请期待!

欢迎国内外参会学者莅临展位329,共同探讨动植物基因组学研究中的新技术和新思路。

“华夏一号”入围『天河之星』超算应用成果展

“华夏一号”入围『天河之星』超算应用成果展未来组应邀参加2016“天河二号”超算用户年会,分享三代测序最新应用成果中山大学国家超级计算广州中心于2016年12月8日至10日举办2016“天河二号”超算用户年会。武汉未来组在“天河二号”超算平台的应用项目——“华夏一号”,入围了2016“天河之星”超算应用成果展,并应邀参加此次会议,分享未来组在“天河二号”上最新应用成果。

作为此次2016“天河之星”超算应用入围成果展中唯一NGS测序项目的用户,未来组在会议中分享了三代测序技术在精准医疗和基因组学中的应用价值。

报告中,未来组也分享了 “华夏一号”的项目经验。该项目启动时,国内外均缺乏纯三代测序数据进行大型基因组(>1Gb)组装的现成经验,已有的生物信息学软件也并不完善,未来组通过对分析流程进行优化升级,并搭载“天河二号”超算平台,极大地压缩了该项目300G数据量的组装周期,顺利完成了第一个基于三代测序的亚洲人参考基因组,为中国人精准医疗提供了新入口和新标准。

未来十年,中国人健康医疗大数据规划将带来更加海量的数据,武汉未来组将依托“天河二号”平台,将三代测序技术的基因组全谱变异检测和医学级基于中国人基因组数据的注释系统Grandbox结合,为中国人提供真正的“精准医疗”。

北京希望组完成A轮近亿元融资,三代测序精准医疗扬帆启

北京希望组完成A轮近亿元融资,三代测序精准医疗扬帆启航

2016年12月5日,北京希望组宣布成功完成由经纬中国和赛富投资领投、清科创投跟投的近亿元人民币A轮融资,将全力推动三代测序技术应用和普及。清科资本担任本次交易的独家财务顾问。

作为中国第三代测序精准医疗公司,北京希望组是目前中国专注于三代测序自主研发的创业团队,立志通过前沿技术的创新应用来帮助提高遗传疾病基因检测精确度和检出率,为遗传病诊疗一线的医学工作者提供一站式大数据解决方案。

目前北京希望组拥有“未来组”和“希望组”两大品牌,分别面向科研和临床用户。作为中国第三代测序科研服务公司,未来组从2011年至今积累了丰富的三代测序实战经验,成为中国三代测序科研服务第一品牌。2015年,未来组成为北京希望组旗下科研服务品牌,帮助将科研服务方面的领先优势迅速转化为极具临床价值的核心竞争力。北京希望组在过去一年中取得多项重要进展,参与发表了“华夏一号”——中国第一个参考序列级别的黄种人基因组近完成图;建立了与包括道培医疗集团在内多家大型医院的三代测序精准医疗战略合作;开发了低覆盖深度全基因组三代测序检出结构变异的产品,将三代测序产品研发与临床需求紧密结合。

北京希望组由汪德鹏先生和王凯教授于2015年初在北京联合创立。汪德鹏先生在测序行业超过十年从业经历,参与多项重要产品孵化和早期推广,致力于探索前沿测序技术发展道路,并因此成为中国三代测序服务第一人。王凯教授在人类基因组科研领域超过十年的研究经历,是基因组大数据分析的国际行业标准制定者之一,并且主导了“华夏一号”这一完全基于三代测序组装策略的黄种人基因组课题。

在此之前,北京希望组于2015年底获得来自六合的天使投资。两轮融资的顺利完成背后,是团队战略和业务增长的不懈努力。本轮融资完成后,北京希望组将加大平台投入,在北京建立国内领先的三代测序平台,并在美国设立首个海外研发实验室;年底前,武汉测序实验室规模将扩大到三台PacBioSequel——这意味着从明年初开始,仅武汉实验室的单月数据产出能力就将超过1 Tb,并且随着Sequel性能提升还会进一步增加。与此同时,北京希望组还将增加研发投入、加快团队建设,在第三代测序技术快速发展的势头之下,为科研和医学合作伙伴提供更前沿、更全面的服务。

经纬中国成立于2008年,管理4支美元基金和5支人民币基金,总值185亿人民币;投资投后团队超过70人。经纬专注早期投资,着眼扎根中国市场的创业公司,我们相信这些新经济公司将全面改变中国人的生活方式和效率。经纬已投资超过370家公司,其中20家在中美等多地上市/ 挂牌,估值50亿美金以上公司6家、10亿美元以上的25家、1亿美金以上的超过100家。经纬关注互联网及移动互联网,如交易平台、企业服务、金融科技、新技术、移动医疗、消费升级、新文化、社交社区等。明星公司包括滴滴出行、陌陌、饿了么、恺英网络、猎豹移动、世纪互联、博纳影业、暴风影音、理邦仪器、土巴兔、找钢网、猎聘网、猿题库、PINTEC品钛、36氪、ofo等。

八年来,经纬在医疗领域已经投资近50家企业,覆盖医疗器械、互联网医疗和医疗服务,在医疗器械及IVD领域,已投资多家优秀企业,包括理邦仪器、瑞奇外科、心诺普医疗等。

赛富投资基金是一家领先的为亚太地区的高成长性企业提供资金支持的私募股权公司,在中国和印度分别设有办公室。赛富目前管理总规模近60亿人民币及40亿美元的投资基金。

赛富的投资领域主要涵盖消费类的产品及服务、科技行业、传媒业、通信行业、金融服务、医疗、旅游业及制造业。赛富主要从事在中国(包括香港和台湾)和印度的项目投资。

赛富在香港、中国大陆和印度拥有多名专业投资人士,与受资企业建立长期密切的合作关系。赛富帮助受资企业拓展其业务,充分发挥受资企业之间的协同效应,为受资企业引入先进的管理程序使股东利益得到最大化。

清科创投于2006年成立,目前管理4支美元基金、12支人民币基金,总规模为40亿元人民币,每年投资数十家高成长企业。清科创投目前已投资100多家优秀企业,涵盖互联网及移动互联网、消费零售及服务、医疗健康等多个行业。借助清科集团在国内强大的网络优势,我们能给被投资企业带来资金以外更多的增值服务,协助被投资企业取得卓越发展。

郑州大学生物信息系师生到访未来组

今日,国家“211工程”重点建设高校郑州大学生物信息系主任王振龙教授带领师生六十余人到访武汉未来组。未来组市场部、生物信息部及实验部等同事就公司概况、生物信息前沿技术发展及应用、新一代PacBio Sequel 测序仪从样品制备到下机数据分析全过程等进行了详细介绍,随后师生一行还深入到生产实验室及Sequel平台近距离参观体验。

双方不仅就前沿技术深入交流,还探讨了创新实践的重要性,学生们也表示在与未来组的交流中获得颇丰。期待未来组与郑州大学生物信息系在生产实习、培训交流和工程实践等方面达成更多互动与合作,为双方在生命科学领域中培养更多人才。

武汉留创园区企业家代表获邀参加国家、省、市国庆招待会

武汉留学生创业园区企业家代表获邀参加国家、省、市国庆招待会

2016-9-30 转自武汉留学生创业园

未来组“第三代测序分析培训班之微生物专题”圆满落幕

经过两个多月的筹备,未来组与武汉生物技术研究院合办的“第三代测序分析培训班之微生物专题”终于与大家见面了。本次培训围绕PacBio技术在微生物研究领域的应用展开了详细的介绍,涵盖样本制备、上机测序、生物信息分析上机操作等。组学君也有幸参加了此次培训,现在给大家分享一下现场情况。

未来组CEO汪德鹏与学员分享了在高通量测序技术的发展、机遇及挑战等方面的独到见解,并建议大家要有预见性地选择自己未来学术的钻研方向。(下图)

PacBio中国独家代理公司——基因有限公司的讲师魏艳洁,介绍了PaciBio测序技术平台及其原理。(下图)

武汉生物技术研究院的付爱思、丁琼讲师就多年在PacBio测序平台中样本提取、建库以及应用等方面的经验积累,做了详细讲解。

武汉大学的陈超讲师,从整个课题项目角度讲解了PacBio在细菌基因组磷硫酰化修饰(PT修饰)中的重要应用。(下图)

未来组的各位讲师向学员们讲解了基于PacBio测序数据在微生物基因组、宏基因组的组装流程,并辅助学员上机操作。

除了在会议室参加培训,未来组也带各位学员实地体验了PacBio最新测序平台Sequel操作,让各位学员近距离与Sequel平台接触。

培训班结束时,学员们纷纷表示三天半的课程安排紧凑充实,短短几天学习内容颇为丰富,培训结束后会加紧脚步,多多练习上机操作,更有不少学员期待参加未来组下期不同专题的培训。

未来组作为中国第三代测序服务品牌,本次举办第三代测序分析培训班的微生物专题,旨在将多年积累的第三代测序在微生物领域的分析经验及最新技术进展分享给各个学科的研究者!未来组会不断改善,根据大家对不同专题的测序分析技术的需求,推出更多系列课程,敬请期待!

美国PacBio公司代表团到访未来组

美国第三代测序仪制造商Pacific Biosciences公司高级产品经理Paul Kotturi 博士、亚太区现场应用经理Sian Loong Au及基因有限公司到访武汉未来组。

Pacific Biosciences公司和基因有限公司到访代表与未来组管理层以及生产、分析技术人员进行了学术交流及行业探讨,双方就最新的PacBio Sequel测序仪的发展与应用、三代测序技术的前景等方面交换了意见,并一致表示将在第三代测序领域进一步合作。

Pacific Biosciences公司是第三代基因测序系统开发和制造公司,主要设计、开发、制造及销售用于基因分析的单分子实时(SMRT)测序技术平台。2013年发布的 PacBio RS II系统已成为目前唯一大规模商业化运行的第三代测序平台;2015年又推出全新的Pacific Sequel 测序平台,通量更高、 体积更小,让测序成本显著降低,项目周期大大减少。

基因有限公司是Pacific Biosciences公司的中国区独家代理商,自2011年就开始将PacBio第三代单分子实时测序技术平台引入中国,目前已与未来组达成了长期战略合作。

武汉未来组已从Pacific Biosciences公司引进3台Sequel测序仪,部署在武汉光谷生物城的未来组生产研发中心,面积超过1000平方米,采用10万级洁净实验室,还搭建了天河Ⅱ号快速组装平台,为高度复杂的动植物基因组项目、人类基因组测序项目、复杂微生物组测序项目等提供最高的测序质量,最快的组装分析速度。

未来组不断升级技术平台,以满足呈指数增长的三代测序服务需求。未来组目前的测序分析服务涵盖了基因组学、转录组学、表观基因组学等多研究领域,为客户提供针对多组学研究相关领域的完整解决方案。