《Scientific Reports》武汉大学药学院携手武汉未来组揭秘PT修饰生物学功能

近期,武汉大学药学院王莲荣与陈实教授课题组与武汉未来组合作,在DNA磷硫酰化修饰(PT修饰)的生物学功能研究方面取得突破性进展,其研究成果发表在scientific reports上。

DNA磷硫酰化修饰即硫原子取代了DNA上磷酸骨架上非桥联的氧原子, 该修饰是他们前期与邓子新院士和Peter Dedon教授发现的DNA骨架上的新型修饰。早期研究发现,该种修饰在有dndABCDE基因簇的细菌中存在,而dndFGH基因簇则能保护细菌免受外源无PT修饰的质粒的迫害,然则并不是所有的细菌都同时有以上2种基因簇。基于此,他们认为PT修饰还具有除R-M系统之外的其它功能,王莲荣与陈实教授课题组采用RNA-Seq的方法对PT修饰的生物学意义进行研究。

研究将无PT修饰的菌株(dndBCDE缺失)与野生型菌株进行对比,发现无PT修饰的菌株中有89个显著高表达的基因及95个低表达基因。其中,高表达基因有些是SOS相关基因、噬菌体相关基因,综上,他们认为无PT修饰的菌株DNA遭到了破坏,进一步研究证实无PT修饰导致了DNA双链的断裂。

图1 XTG102(dndBCDE缺失)、XTG103(dndB-H缺失)、XTG104(dndF缺失)与野生型表达差异图。红色,上调;绿色,下调

参考文献

Rui Gan1* X W, 2*, Wei He1, Zhenhua Liu3, Shuangju Wu1, Chao Chen1, Si Chen1,Qianrong Xiang1, Zixin Deng1, Dequan Liang3, Shi Chen1 & Lianrong Wang1. DNA phosphorothioate modifications influence the global transcriptional response and protect DNA from double-stranded breaks [J]. SCIENTIFIC REPORTS,2014

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