2023 Nature Index公布：希望组再登上榜单
近日，Nature Index官网更新了最新的自然指数排名，希望组再次登上该榜，在生命科学领域大陆测序企业排行榜中名利前茅，更重要的是，FC分值相较上一年增长了228.2%（本次榜单统计自2022年1月1日至12月31日）。
2022年希望组共合作发表文章近50篇，总影响因子700+，其中包含Cell、Nature Genetics、Nature Plants、Molecular Plant、Nature Communications等高质量期刊，涵盖基因组学、转录组学、宏基因组学等研究领域。下面就让我们来回顾一下希望组2022年被收录到自然指数的几篇重要文章吧。
Nature Genetics 燕麦高质量参考基因组组装揭示其生物起源和进化
2022年7月18日，希望组与四川农业大学、吉林省白城市农业科学院等团队合作在Nature Genetics上发表了题为“Reference genome assemblies reveal the origin and evolution of allohexaploid oat”的研究论文，本研究发布了六倍体栽培裸燕麦及其二倍体和四倍体祖先的参考基因组，并进一步选择能代表燕麦属现存所有基因组类型的二倍体、四倍体和六倍体材料结合全基因组测序、叶绿体基因组和转录组分析，深入探究六倍体燕麦的起源与亚基因组进化。（燕麦高质量参考基因组组装揭示其生物起源和进化）
Nature Genetics 甘蔗割手密种的近期基因组演化
2022年6月2日，希望组与福建农林大学生命科学学院国家甘蔗工程研究中心、广西甘蔗生物学重点实验室等团队合作在Nature Genetics上发表了题为“Genomic insights into the recent chromosome reduction of autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum”的研究论文，本研究提供了同源四倍体甘蔗割手密的基因组资源，完成了割手密Np-X(2n=4x=40)高质量同源多倍体基因组测序，完整的组装了10组同源染色体的共40条染色体基因组，提出了加速甘蔗改良的新方向，扩展了对同源多倍体进化的认识。（甘蔗割手密种的近期基因组演化）
Nature Communications 羊膜选择内在遗传不稳定性来保护种系基因组的完整性
2023年2月13日，希望组与美国罗切斯特大学医学中心生物化学和生物物理学系RNA生物学中心、西北农林科技大学动物科学与技术学院等团队合作在Nature Communications上发表了题为“Amniotes co-opt intrinsic genetic instability to protect germ-line genome integrity”的研究论文，本研究通过对鸡、鸭、小鼠和人类的比较研究，以及对不同品种鸡的长读长纳米孔测序，揭示了粗线期piRNA的功能，以及其快速进化历程。（羊膜选择内在遗传不稳定性来保护种系基因组的完整性）
Nature Communications 短读和长读宏基因组学扩展了肠道微生物组的个体结构变异
2022年6月8日，希望组与中国科学院微生物研究所、中国科学院大学等团队合作在Nature Communications上发表了题为“Short- and long-read metagenomics expand individualized structural variations in gut microbiomes”的研究论文，本研究建立了基于三代测序和二代测序的混合组装方式，不仅提高了数据质量，扩大了遗传变异的检测范围，也有利于原噬菌体以及CRISPR spacers等基因元件的发现。SVs调节影响宿主代谢组和健康的细菌功能，要求对细菌对人类健康和疾病的贡献进行更精细的研究，而不仅仅是关注细菌丰度。将长读长（ONT）进一步纳入肠道微生物组研究将有助于深入剖析特定时间的肠道微生物组功能，并加深研究人员对人类各种肠道疾病轴的理解。（https://baijiahao.baidu.com/s?id=1735553124836634087&wfr=spider&for=pc）
PLOS Genetics 长读测序确定癌症的新结构变异
2023年2月22日，希望组与华中科技大学同济医学院等团队合作在PLOS Genetics上发表了题为“Long-read sequencing identifies novel structural variations in colorectal cancer”的研究论文，本研究提供了一个示例，说明长读长纳米孔测序在癌症基因组研究中的实用性。这项工作强调了长读长测序作为CRC精确诊断和治疗的新平台的潜力，并描绘了CRC中长读长测序检测到体细胞SVs的第一个图景，这可能是未来生物学和临床研究的有用资源。（长读测序确定癌症的新结构变异）
希望组自成立以来一直深耕长读长测序技术与应用开发，凭借多年深厚的技术积累与合作伙伴的充分信任，在科研服务和医学研究等领域不断产出重大科研成果，今年6月更是实现了CNS大满贯。未来希望组将继续专注于长读长测序领域的开发与拓展，迎接新的机遇与挑战，力争与合作伙伴一起取得更好更多的科研成果，推动基因组学的研究与应用，让生命充满希望。
关于Nature Index
自然指数通过追踪机构和国家发表在82种高质量自然科学期刊上的科研论文，呈现全球高质量科研产出及合作情况。
