希望组basecalling流程升级:每月2700张Cell数据处理量 一骑绝尘!

时至今日,三代长读长测序(long-read sequencing)技术在生物领域应用的如火如荼,许多专家都认可了其先进的方法和广泛的应用,《Nature Method》也将三代长读长测序评选为了2022年度最佳方法。

在整个Nanopore 单分子实时测序的流程中,basecalling(碱基识别)环节是测序流程一个重要的步骤,basecalling需要对原始测序数据进行复杂的信号处理和算法计算,这一环节的处理精度决定了测序数据的准确性,其中basecalling的不同处理模式对于计算资源的需求和产出数据的精度不尽相同(详见往期推文)

希望组一直致力于改进信号处理方法、优化算法模型,并升级硬件计算平台,以提高base calling的准确性和效率。希望组引进的100张全新GPU计算处理器(详见往期推文),通过大规模并行计算架构强有力的提升希望组计算中心的数据处理能力,为了最大程度发挥硬件平台的计算潜力,希望组重新编写了basecalling流程算法,使计算平台数据产出能力产生质的飞跃!

(注:数据产出以Nanopore Ultra-long Super basecalling计)

希望组Nanopore Ultra-long产品本就在reads长度和数据产量上遥遥领先,在结合了希望组basecalling全新流程后,更是如虎添翼,将原本需要花费1-2周的basecalling环节缩减到2-3天,为各位老师们节约大量的科研时间。

希望组作为国内首家投入三代测序的测序企业,始终致力于推动三代测序技术的不断发展。此次的basecalling流程升级将只是一个起点,希望组将不遗余力的改进测序流程、开拓分析技术、精进分析算法,为客户们带来最顶尖的科技服务产品!

如果您对我们的Nanopore测序产品感兴趣,您可以与当地的销售人员进行联系,我们将会为您提供测序服务的详细资料以及更多信息和支持。

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