国家农业基因组科技创新联盟总结会成功召开

2018年12月13日,国家农业基因组科技创新联盟(简称“联盟”)总结会于深圳完美闭幕,此次会议以“大科学计划、优势互补、互利共享、成果共享”为主题,由国家农业基因组科技创新联盟和中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合主办,由武汉未来组生物科技有限公司承办,是“联盟”成员共享农业基因组学硕果、共商农业科技创新战略的盛事。

“联盟”成立于2017年,由农业部主导,由国家级、省级农业科研教学机构、现代农业龙头企业共80家单位组成,含中国农业科学院、中科院、北京大学、十多个省级农科院等成员,着力解决农业基因组学发展中全局性重大战略与共性技术难题,开展农业基因组科技协同创新的合作组织,各级农业行政主管部门对联盟开展科技创新和成果推广提供业务指导和支持等。近日武汉未来组也受邀加入“联盟”,参与共建工作。

本次会议由中国农科院基因组所黄三文所长主持,中国农科院基因组所骆建忠书记、科创委和经信委领导等分别致辞,黄三文所长、钱万强助理和阎萍老师详细介绍了联盟情况、合作单位和扶贫单位等,且由与会成员分享了各自在农业基因组学、农业分子育种、农业和食品宏基因组等领域的成果。“联盟”在农业生物组学基础、基因组学与动植物育种、基因组学与动植物健康三大学科领域取得突出进展,“联盟”成员对于国家农业科技的创新应用提出了各自的规划和展望。

未来组基于长读长(Nanopore/Pacbio)单分子实时测序技术,解决了动植物基因组组装中高杂合度、高重复区域、异常GC含量等诸多难题,大大提升组装连续性,重新定义ContigN50、ScaffoldN50交付指标。在细菌基因组研究领域,未来组基于Oxford Nanopore平台充分发挥了超长读长的优势,轻松跨越细菌基因组中的重复与复杂区域,实现了对DNA碱基修饰的直接分析,使组装简便快捷。同时,未来组搭建的Pacbio Sequel测序平台可读取多圈全长扩增子,获得准确度无限接近1的环状一致性序列,进而真实反映微生物群落和菌群的组成。最新出炉的PacBio System 6.0数据以及Nanopore PromethION数据均处于行业优势水平,研发的Ultra long reads最长读长超过1Mb,基于超长读长测序和超算平台,一天可完成一个动植物基因组组装。基于PacBio SMRT、Oxford Nanopore、BioNano光学图谱及Hi-C染色体构象捕获等技术平台并搭载天河二号和阿里云等高性能集群,未来组解决了动植物基因组、微生物基因组、全长转录组及微生物群体研究等领域的技术瓶颈,推动了基因组学研究的升级换代。同时,未来组将继续开拓创新,继续开发基于三代测序技术的全新算法流程,进一步压缩动植物、微生物及宏基因组等的组装分析周期,为高校及科研院所等提供高效、准确、可靠的科研服务。

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