未来组携最新数据邀您体验超大型基因组全方位进击攻略

世界上拥有超大型基因组(>10Gb)的物种不下2000种,但真正完成测序的却寥寥无几。超大型动植物基因组往往高重复,或多倍体或发生过多倍化事件,其从头测序和序列组装成为世界性难题。Oxford Nanopore公司开发的PromethION测序仪,由于其通量高、读长长的特点,极大地降低了基因组测序成本,大大地简化了基因组的拼装,再结合高效组装算法和高配置服务器,超大型基因组有望快速准确地解码。

未来组优势

1 超长序列,超高产量Nanopore PromethION平台

  • 高达144,000个信号通道
  • 数据产出约6.2Tb/48h
  • 平均读长15-25kb
2 多样化平台,一站式服务–Nanopore+Bionano+Hi-C

  • 全新DLS非酶切标记技术
  • 超长DNA分子物理图
  • 高分辨率检测基因组结构变异

  • Hi-C辅助基因组组装
  • 构建染色体级别Scaffold
3 自主开发的高效组装算法–NextDenovo组装算法
  • 自主研发长读长序列高效组装算法
  • 长读长序列校正,有效提升reads质量
  • 高速运算,准确拼装
4 高配置服务器:超大容量硬件配置–华为云高性能超算服务器 
  • 独立数据释放节点
  • 无限制存储容量
  • 云端资源弹性扩展

未来组组装案例

01 Nanopore PromethION下机数据展示

在Oxford Nanopore PromethION平台对某超大型动物基因组进行测序,平均reads 18.3kb,长读长是后续进行更准确基因组组装的前提。

02 基因组组装结果展示

利用未来组自主研发的组装软件NextDenovo,大大提高了组装效率,对通过流式和survey确定为39Gb的超大型动物进行组装,组装出的基因组大小为38.6Gb,Contig N50达到1.6Mb,是迄今为止唯一一个组装的Contig N50达到Mb级别的超大型基因组(>10Gb)。

未来组推荐策略

作为三代测序基因组学中心,未来组拥有最新的Oxford Nanopore PromethION测序平台和BioNano光学图谱,HiC等技术,同时配备高水平生信分析团队,已经完全可以解决超大型基因组的难题,我们将继续致力于攻克更多超大型复杂动植物基因组图谱,为您提供高质量、高准确度的测序、组装、分析服务。
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