微生物是地球上最丰富、最多样的生命形式，它们是所有生态系统的重要组成部分，在医疗健康领域和工业应用领域中发挥着至关重要的作用。微生物基因组学研究在医学上可应用于致病相关基因的鉴定、开发新型抗生素等，而在生物技术上可用于生物降解、酶工业、食品生物以及抗生物质的研究，同时对进化、功能预测等方面也有着重要意义。

自1994年美国发起微生物基因组研究计划（MGP）以来，微生物组学在生物领域蓬勃发展，而在2001年中国绘制出首张微生物基因组“完成图”以后，随着高通量测序技术的诞生，微生物基因组研究也进入了井喷期，我国先后启动了万种微生物基因组计划、百万微生态系统基因组计划等。

研究的深入依赖技术的进步。短读长测序技术由于无法跨越富含重复区域的基因组使得很多微生物研究止步于基因组草图，而长读长测序技术却可以轻松获取细菌基因组完成图，同时在复杂微生物群落的鉴定中可达到“种级别”的鉴定水平。Frank等人于2016年结合Hiseq2000和PacBio RS II对沼气反应器内微生物宏基因组进行研究发现PacBio技术能显著提升组装水平[1]，而2013年Chin等仅运用PacBio就组装出16个微生物基因组，与参考基因组一致性达99.9999%[2]。

如果说PacBio技术为微生物研究打开新世界的大门，那么基于纳米孔电流检测的ONT技术则开启了微生物组学的黄金时代！

全基因组从头组装

案例1：野生型酵母全基因组从头组装^[3]

有意思的是，研究还将两种MinION测序芯片R7.3和R9对DDNA#1线粒体基因组中AT含量富集的一个区段的测序组装结果和Candida vartiovaarae线粒体基因组进行比较，发现升级后的芯片R9表现要好得多（如Fig.1所示）。

Fig.1 两种MinION芯片数据组装的DDNA#1线粒体基因组覆盖情况

最后，研究还将组装的DDNA#1基因组和其他酵母的基因组进行了比较，得出了野生型酵母杂合度较高的结论，并指出ONT数据对于酵母菌株分类的可靠性，而且，使用ONT结合其他测序平台的数据对基因组注释也颇有助益。

群体遗传分析

案例2：酵母基因组从头组装及群体遗传变异研究^[4]

法国Genoscope的研究人员同样利MinION对Saccharomyces cerevisiae S288C菌株进行测序来评估ONT组装的有效性，从头组装了代表S. cerevisiae遗传多样性的21个菌株，分析表明ONT数据组装出的基因组连续性比仅用Illumina组装出的高出14倍，且有65%的染色体仅含1—2条contigs。

同时，研究也对S288C菌株也进行了ONT测序，并利用Illumina reads进行校正，22个菌株组装得到的基因组结果如Table 1所示，基因组大小介于11.83Mb到12.2Mb之间。菌株CEI的Contig数最少（18个），平均Contig数为27.5，组装结果都较完整。

Table 1 使用SMARTdenovo组装的22个菌株连续性情况

接着，研究者将组装得到的基因组与已知的酵母TE家族（Ty1-Ty5）进行比对，发现S288C组装注释的50个 TEs有47个都在染色体的正确位点，表明Nanopore策略组装的基因组用于鉴定TE准确性较高。得益于ONT数据可以确定串联基因的拷贝数，研究在组装基因组中搜寻到了CUP1和ENA1-2两个关键的串联重复基因并发现其在21个菌株中极其分化，除此之外还分析了易位和倒位等更大的结构变异。研究者借此也表明，结构变异检测的准确性高度依赖组装的完整性。最后，研究还分析了菌株间线粒体基因组的变异，将它们比对到参考序列上比较分析了检测到的SNPs、插入-缺失、重复区域、基因间区变异等。

特有基因快速检测

案例3：Nanopore检测肠杆菌抗生素耐药性基因^[5]

研究从20个污水处理厂收集的样本中鉴定出具有抗生素耐药性的9种肠杆菌科细菌，并检测出其中三种主要的抗生素酶A、B、D，在进行Illumina全基因组测序后与耐药性基因数据库进行比对找到了三种酶对应的抗生素，发现三个对某种抗生素具有高耐药性的菌种都含有blaOXA-48基因。

研究在单独检测Illumina数据时没有组装到blaOXA-48基因，只能定位到其处于三个组装基因组上的三个不同长度的contig上。于是研究人员又进行了Nanopore MinION测序，不仅首次组装出了Enterobacter kobei的基因组完成图，而且另两个菌种的基因组也都是高质量的，借此组装出了三个菌种编码blaOXA-48基因的质粒。

Table 2 基于Illumina和MinION数据对九种菌种基因组的组装统计

跨越重复序列

案例4：ONT挑战长重复序列原核生物基因组组装极限^[6]

假单胞菌Pseudomonas koreensis P19E3的基因组含有长达70Kb的重复序列，以及变异的shufflon区域，即便是使用PacBio测序也难以获得满意的组装结果。研究者使用读长更长的Oxford Nanopore测序技术，完成了对Pseudomonas koreensis P19E3的基因组组装，论文发表在Nucleic Acids Research上。

该研究分别采用不同的测序技术对P. koreensis P19E3进行测序，获得的reads结果如Table 3所示，PacBio reads N50为16.9 Kb，而ONT reads N50则高达44.9 Kb。

Table 3 三种测序技术基本数据

利用PacBio数据，HGAP3软件组装得到14条contigs，Flye组装得到7条contigs，都不能得到P. koreensis P19E3的基因组完成图。而利用ONT数据则组装得到一条6.44Mb大小的染色体和4个质粒，将P. koreensis P19E3基因组完整组装出来。同时，制约P. koreensis P19E3基因组完成图的另一主要障碍是高重复的shufflon区域，利用ONT数据和Flye软件也很好的破译了该区域序列。

参考文献

[1] Frank JA, Pan Y, Toomingklunderud A, et al. Improved metagenome assemblies and taxonomic binning using long-read circular consensus sequence data［J］. Scientific Reports, 2016, 6：25373

[2] Chin CS, Alexander DH, Marks P, et al. Nonhybrid, finished microbial genome assemblies from long-read smrt sequencing data［J］. Nature Methods, 2013, 10（6）：563-569.

[3] Jansen HJ, Dirks RP, Liem M et al. De novo whole-genome assembly of a wild type yeast isolate using nanopore sequencing, F1000Research 2017, 6:618 

[4] Istace B, Friedrich A, D’Agata L, et al. de novo assembly and population genomic survey of natural yeast isolates with the Oxford Nanopore MinION sequencer[J]. Gigascience, 2017, 6(2):1-13.

[5] Ludden C, Reuter S, Judge K, et al. Sharing of carbapenemase-encoding plasmids between Enterobacteriaceae in UK sewage uncovered by MinION sequencing[J]. Microbial Genomics, 2017, 3(7).

[6] Schmid M., et al. Pushing the limits of de novo genome assembly for complex prokaryotic genomes harboring very long, near identical repeats, Nucleic Acids Research, gky726,https://doi.org/10.1093/nar/gky726.

两栖动物是动物发展历程中的关键群体，作为第一批登陆的脊椎动物，在动物从水生到陆生的进化过程中起着“承先启后”的重要作用。两栖动物能在陆地存活，但无陆地繁殖的本领，是一群过渡类群，这种独特的生命史使其对气候变化十分敏感。

众所周知，基因组记录了物种的遗传信息，物种的进化必定是建立在基因组的进化之上，于是人们很自然地把基因组的大小与物种在进化上的复杂程度相关联起来。然而它们的演化轨迹是否完全一致呢？在漫长的进化史中又有哪些因素会导致基因组大小的变化呢？为了解开基因组大小演化中的这个谜题，西班牙和英国研究者通过大规模的两栖动物发育系统及多种进化模型研究了两栖动物生命史，揭示了影响两栖动物基因组演化趋向的关联因素并且发现气候变化可间接影响两栖动物基因组大小，论文于近日发表在nature ecology & evolution上。

两栖动物是动物发展历程中的关键群体，作为第一批登陆的脊椎动物，在动物从水生到陆生的进化过程中起着“承先启后”的重要作用。两栖动物能在陆地存活，但无陆地繁殖的本领，是一群过渡类群，这种独特的生命史使其对气候变化十分敏感。

众所周知，基因组记录了物种的遗传信息，物种的进化必定是建立在基因组的进化之上，于是人们很自然地把基因组的大小与物种在进化上的复杂程度相关联起来。然而它们的演化轨迹是否完全一致呢？在漫长的进化史中又有哪些因素会导致基因组大小的变化呢？为了解开基因组大小演化中的这个谜题，西班牙和英国研究者通过大规模的两栖动物发育系统及多种进化模型研究了两栖动物生命史，揭示了影响两栖动物基因组演化趋向的关联因素并且发现气候变化可间接影响两栖动物基因组大小，论文于近日发表在nature ecology & evolution上。

Fig. 1 两栖动物系统发育树

已有的研究表明，基因组大小与细胞核大小、营养物需求、生命周期复杂性、基础代谢、细胞周期、组织分化和发育速率等有关。该研究通过系统发育方差分析表明，生命周期复杂性与基因组大小之间没有显著相关性（Fig. 2a，2b）。在有尾目中，幼形遗留物种基因组大小与非幼形遗留物种之间亦没有显著差异（Fig. 2c）。由此表明，两栖动物基因组大小与是否有幼虫发育阶段无关，反驳了早期基因组大小与是否存在变态发育有关的研究结论。

Fig. 2 两栖动物基因组大小进化的祖先状态重建表征图

为了检测基因组进化速率随着时间的推移在两栖动物不同目之间的差异，明确有尾目特征空间的变化是自发变化还是突变进化的结果，研究者采用BAMM算法估计基因组大小进化速率，结果表明，有尾目基因组大小进化较无尾目更慢（Fig. 3a），蚓螈目处于中间状态，且随着时间的推移，到现代有尾目进化速率下降，而蚓螈目和无尾目进化速率均有缓慢的增加（Fig. 3b）。进化模型拟合表明，无尾目和蚓螈目的基因组是在共同的Brownian motion过程下进化的，而有尾目基因组的进化过程则截然不同。

Fig. 3 两栖动物三个目的基因组大小进化速率评估

环境温度是变温动物生理机能的重要决定因素，影响细胞复制、代谢和发育。而已有研究表明快速发育导致无脊椎动物基因组大小的减小，因此推测环境温度的变化可能在基因组大小进化中具有重要作用。该研究结果表明，在无尾目和有尾目中，环境和生活史相关，高温和干旱显著减少其发育时间。在无尾目中，基因组大小与发育周期相关，短的发育周期其基因组也较小。由此可见，气候变化可间接影响两栖动物基因组大小。

在整个生命之树中，基因组大小的显著变化是随时间渐进式进化导致的还是间断式进化的结果一直存在争议。研究认为这两个过程都有贡献，尽管当间断事件发生的时候可能会对基因组大小进化的整体模式产生深远的影响，但是间断事件罕见。研究也推测Brownian-motion-like的进化模式可能是分子过程相互作用的结果，主要是转座子含量的变化，其可导致多倍化或复制事件甚至是突变的基因组进化。

生态系统形成于长期的演化，系统中的物种经过成百上千年的竞争、排斥、适应和互利互助才形成了现在相互依赖又互相制约的密切关系。一个外来物种被引入后，可能因不能适应新环境而被排斥在系统之外；也可能因新的环境中没有相抗衡或制约它的生物加上其旺盛的繁殖力和强大的竞争力而改变或破坏当地的生态环境，甚至对人类安全和经济发展造成危害。

面对外来入侵物种触发的环境警报，人们也对其采取了一定措施：例如人工防治、化学防治及生物防治等多种手段。这些方法虽然可在一定程度上控制其蔓延趋势，但是很难从根本上逆转生物入侵造成的后果。因此，科研工作者开始致力于解析入侵物种的遗传密码，期望找到其环境适应性的基因组学基础，为入侵物种带来的生态危机寻找新的突破口。

随着高通量测序技术的快速发展及测序成本的持续下降，入侵物种基因组研究已逐渐打开新的局面，如美洲大蠊和大理石纹螯虾基因组均于今年发表在Nature子刊，近期又有蔗蟾及福寿螺基因组陆续发表。可见，入侵物种基因组研究已日渐受到研究者们的重视。

物种：美洲大蠊

拉丁名：Periplaneta americana

基因组大小：3.38 Gb

测序策略： Illumina

组装指标: Scaffolds N50=333kb

发表期刊：Nature Communications

发表时间：2018

美洲大蠊原产于非洲北部，在16世纪从非洲迁入美洲，并从此传遍世界各地，如今在中国各省市广泛分布。美洲大蠊食性复杂，适应能力极强；无需进行交配，就能通过孤雌生殖的方式进行繁殖，后代皆为雌性蟑螂，这些雌性蟑螂又能自己繁殖后代。研究者指出，一定数量的美洲大蠊在孤雌生殖的情况下，只要3年就能繁殖超过4代，足以对公共健康造成威胁，因为它们可作为病原体和室内过敏原的潜在载体。令科学家们恐惧的是，由于雌性蟑螂繁殖无需雄性，使得遏制蟑螂种群的问题变得棘手。

中科院植物生理生态研究所詹帅研究组与合作者对美洲大蠊进行了全基因组测序，组装得到3.38Gb美洲大蠊基因组，通过基因组及其功能分析对美洲大蠊的城市环境适应性和可塑性发育进行研究^[1]。与其它昆虫比较发现，美洲大蠊扩张的基因家族主要与环境适应性有关，如化学感应和解毒，这些是美洲大蠊拥有广泛的环境适应性的基础。此外，研究人员也鉴定出了美洲大蠊参与发育和再生的信号传导路径。美洲大蠊有望作为一个模式物种被研究者用来开展蟑螂的生物学研究，基因组密码的破解将为防治美洲大蠊提供新思路。

物种：大理石纹螯虾

拉丁名：Procambarus virginalis

基因组大小：3.5 Gb

测序策略：Illumina

组装指标: Scaffolds N50=39.4 kb

发表期刊：Nature Ecology & Evolution

发表时间：2018

大理石纹螯虾（P. virginalis）作为一个热点物种，也是通过孤雌生殖的方式进行繁殖，令人惊奇的是，在大约25年前大理石纹螯虾还不存在。分子生物学家FrankLyko的团队对一只来自实验室的大理石纹螯虾进行基因组测序^[2]，基因组大小约3.5Gb，鉴定出21,000多个基因。更进一步的研究发现，大理石纹螯虾基因组的许多位点都有两种不同基因型，其中两条染色体序列几乎完全相同，但第三条却明显不同，两条染色体与P.fallax亲缘相近。

系统的野外实验和基因分型结果揭示了大理石纹螯虾在马达加斯加的快速扩张并确定其为淡水系统强有力的入侵物种。为了更好地了解该物种的传播规律，Lyko团队又测序了四只P.virginalis，测序结果显示P.virginalis的遗传多样性严重匮乏，事实上，所有P.virginalis似乎都起源于1995年德国发现的那只雌性大理石纹螯虾。

大理石纹螯虾具有独立的遗传变异，这一特性被认为是其在不同生境快速入侵的决定性因素，如随机表观遗传变异和/或表观遗传可塑性在大理石纹螯虾的快速适应性中发挥了重要作用。

物种：海蟾蜍

拉丁名：Rhinella marina

基因组大小：2.55Gb

测序策略：PacBio RSII+Illumina

组装指标: Scaffolds N50=168 kb

发表期刊：GigaScience

发表时间：2018

海蟾蜍（R. marina）原产于中美洲和南美洲，现已被引进世界很多其它地方，因它们的快速适应能力和对入侵地区土著动物的毒性而闻名。1935年，海蟾蜍被引进澳大利亚，释放到昆士兰州北部的甘蔗种植园内，用来控制甘蔗甲虫的危害（因此也被称为甘蔗蟾蜍）。而如今，澳大利亚海蟾蜍的数量已经超过了1亿只。海蟾蜍的毒性非常大，对于大多数动物来说，如果吞吃了它们的卵、蝌蚪或者成体，会立刻引起心力衰竭而死亡，这使得这种生物在澳大利亚境内几乎立于不败之地。此外，它还导致以本地蛙类为食的袋鼬已经有濒临灭绝的危险。

澳大利亚科学家WhiteP.等分析了海蟾蜍基因组^[3]，基因组大小为2.55Gb，重复序列占63.9%，是蟾蜍科首个报道的基因组。对组装序列进行BUSCO评估，在海蟾蜍基因组中可以找到90.6%的完整基因元件，说明绝大部分保守基因组装得比较完整，从侧面反映组装结果可信度较高。进一步对基因组进行注释，得到25,846个编码基因，与SwissProt数据库已知蛋白相似。

海蟾蜍基因组的解码为进一步认识无尾目动物的生物学遗传特性和入侵物种的进化奠定基础。更重要的是，这些数据将能够促进生物防控策略的创新和应用，从而减少海蟾蜍对本地物种的侵害。

物种：福寿螺

拉丁名：Pomacea canaliculata

基因组大小：440.1 Mb

测序策略：PacBio + Hi-C

组装指标: Contig N50=1.1 Mb

发表期刊：GigaScience

发表时间：2018

福寿螺(P. canaliculata)是一种淡水蜗牛，原产于南美亚马逊河流域，被列为全球100种最具威胁的外来物种之一，可造成农业生态系统的破坏和其它水生物种的灭绝。它的繁殖能力极强，生长速度快，耐受性强，对环境具有很强的适应性。

中国科学家通过Hi-C技术辅助PacBio组装得到福寿螺染色体级别的高质量基因组^[4]，基因组大小约440Mb，重复序列占11.4%，共鉴定21,533个基因。该研究主要发现了DNA/hAT-Charlie转座子的近代扩张、P450基因家族的扩张，以及细胞内稳态系统的组成，在胁迫环境的生态适应性中发挥重要作用。此外，卵巢和蛋白腺中卵黄蛋白周围基因的高水平转录促进了卵细胞营养供应和防御能力的提高。研究者还对福寿螺肠道进行宏基因组研究，发现许多用于食物消化和异生物降解的基因。这些研究成果为进一步研究福寿螺的生态适应性和高入侵能力的分子机制提供了新的视角。

除了以上物种之外，很多入侵植物也对当地的生态环境造成了严重影响：例如在我国云南地区疯长蔓延的紫茎泽兰、在南方地区河流水域大面积覆盖的凤眼莲、空心莲子草等……但关于入侵植物基因组的研究目前仍是一片空白。

物种：紫茎泽兰

拉丁名：Eupatorium coelestinum L．

基因组信息：——

紫茎泽兰原产于中美洲，大约20世纪40年代紫茎泽兰由中缅边境传入云南南部，1935年在云南南部首次发现，随河谷、公路、铁路自南向北传播，时至今日，已覆盖云南80%的土地，并且大约以每年10-30公里的速度向北和向东扩散，目前已被列入我国首批外来入侵物种的第一位。紫茎泽兰是农、林、牧生产的大敌，其侵入农田、草地后与农作物、牧草竞争土壤养分和空间，严重影响农作物、牧草的生长。

物种： 凤眼莲

拉丁名：Eichhornia crassipes

基因组信息：——

凤眼莲又称水浮莲、水葫芦，原产于南美洲，1901年，凤眼莲作为一种观赏植物被引入我国，后作为猪饲料被推广种植。其根系发达，适应性强，在生长适宜区，常由于过度繁殖而抢占水面，致使大量水生生物因缺氧和阳光不足而死亡，破坏水中生态平衡。

物种：空心莲子草

拉丁名：Alternanthera philoxeroides

基因组信息：——

参考文献

[1] Li S,Zhu S, Jia Q, et al. The genomic and functional landscapes of developmental plasticity in the American cockroach[J]. Nature Communications,2018, 9(1).

[2]Gutekunst J, Andriantsoa R, Falckenhayn C, et al. Clonal genome evolution and rapid invasive spread of the marbled crayfish [J]. Nature Ecology &Evolution, 2018, 2(3):567.

[3]Richard J Edwards, et al. Draft genome assembly of the invasive cane toad, Rhinella marina [J]. GigaScience, 2018.

[4]Conghui Liu, et al. The genome of the golden apple snail Pomacea canaliculata provides insight into stress tolerance and invasive adaptation [J].GigaScience. 2018.

i5K最初在2011年的科学杂志和美国昆虫学会上提出，是一项测序5000种节肢动物基因组的计划，目的是为节肢动物在分子水平上的研究提供基础参考。近日，美国印第安纳大学、德国明斯特大学等49家国际科研单位在bioRxiv预印网站上联合发表题为《The Genomic Basis ofArthropod Diversity》的文章，从基因组角度揭示节肢动物多样性的基础^[1]，为I5K计划新添浓墨重彩的一笔。节肢动物多样性居动物界首位，在生态系统中发挥着重要作用，但在分子水平上却仍具有很高的保守性。详细解析节肢动物超多样性分类群的基因组序列变化能够帮助我们更深入的探究其基因组进化的问题。

研究者选取了76种节肢动物的全基因组序列，代表了跨越约5亿年节肢动物进化史的21个目。通过全基因组序列分析，研究比较并解释了基因和蛋白结构域的变化，鉴定了许多在节肢动物进化早期和分化成为当下昆虫阶元过程中出现的新基因家族，还揭示了节肢动物DNA甲基化模式的转变，并发现了基因家族和蛋白结构域进化与表型和生理适应性同步出现的例证。这些分析表明大规模比较基因组学研究可以为基因型到表型的映射提供新见解，并且可以进一步提出关于动物多样性进化的可检验假说。

选取76种节肢动物结合3个外群，采用OrthoDB基因同源数据库从76个物种中共注释了38,195个同源蛋白质组（orthologous proteins groups），28种i5K试点项目测序的物种共注释了533,636个基因模型（gene models），如Fig.1所示。

Fig.1 i5K试点项目76个物种OrthoDB同源性分析

研究者基于目阶元的单拷贝同源基因组，构建了所有主要节肢动物家系的系统发育树（Fig.2）。除了甲壳类我们认为是单系发育而之前认为是六足类复系之外，大部分与前期已报道的节肢动物发育树相一致。该研究对76种节肢动物每个家系的38,195个同源蛋白质组进行基因和蛋白域重构，用于后续分析。

Fig.2节肢动物系统发育树

研究者进一步根据系统发育树对基因家族进行扩张和收缩分析，发现有181,157个基因家族扩张，87,505个基因家族收缩。68,430个基因家族至少在一个家系中消失，其中，9,115个家族出现在不同群体中。变化最大的几个基因家族编码蛋白涉及的主要功能有抵御外来生物（细胞色素P450s，磺基转移酶）、消化（肽酶）、几丁质骨架结构和代谢、多锌指转录因子类型、HSP20域胁迫响应、脂肪酸代谢和蜕化类固醇代谢等。

根据系统发育树还可推测祖先节肢动物的特点。如在最近的昆虫祖先（LICA）中共鉴定9,061个基因，147个基因家族，且有些家族在昆虫发育和适应性进化中发挥重要作用，而在完全变态昆虫进化过程中只鉴定到10个基因家族，表明在过渡的过程中许多基因家族已经存在（Fig.3A、B）。基因家族的变化可能是某一特殊表型过渡的基础。

Fig.3 基因家族，蛋白域和甲基化分析

在昆虫特定的目中，研究者还发现了大量的基因，引人注目的是，在鳞翅目节点处有1038个基因家族，是所有家系节点中基因家族最多的（Fig.3C）。

结果还发现，种特异性基因家族扩张受自然选择的影响，如切叶蚁，在世界各地人类住房中随处可见，在节肢动物中快速进化的基因家族数最高，同时，还发现其基因扩增和丢失以及蛋白结构域重排比率也是最高的（Fig.3D、E）。

研究者对不同节肢动物之间DNA甲基化水平进行了研究，结果发现，半变态昆虫和非昆虫的节肢动物DNA甲基化水平要高于全变态昆虫。对所有蜘蛛类和树皮蝎子基因组甲基化就行分析，发现蜘蛛类甲基化比率很高，显现出明显的双峰（Fig.3F）。

Fig.4 节肢动物基因组变化速率

有趣的是，研究结果发现基因扩增和缺失比率与结构域重排间有着很强的关联，而氨基酸替换率变化与基因扩增和缺失比率没有关联（Fig.4）。

i5K计划已组装出前无古人的节肢动物基因组数据集，并已在农作物、森林虫害等方面建功卓著，而该研究则全面分析了跨越5亿年节肢动物门的基因组，发现主要的形态转变不能归因于基因组某一特定改变，而是关联一系列复杂的基因网络。要更好的理解基因型和表型之间的映射关系需要更深入的研究来验证基因组学的假设，而多样性丰富的节肢动物正为表型研究提供了无可比拟的材料，结合易处理的实验属性，该领域的研究将来还有极其广阔的前景。多样性基因组研究将促使节肢动物以往的类群划分，概念定义乃至整个系统演化脉络都发生深刻的变化。

武汉未来组凭借自身拥有的PacBio Sequel、GrindION、PromethION、BioNano光学图谱、HiC染色体构象捕获技术和平台，以及丰富的基因组学经验，推出了“TOP1000昆虫基因组计划”、“个人参考基因组服务计划”、 “华夏万人结构变异计划”等。在承诺高标准交付指标的同时，未来组将进一步大幅压缩项目服务周期，为合作伙伴提供专业优质的服务。

参考文献

Thomas, G.W.C., et al., The Genomic Basis of Arthropod Diversity. bioRxiv, 2018. http://dx.doi.org/10.1101/382945.