武汉未来组邀您参加第七届全国微生物基因组学学术研讨会

第七届全国微生物基因组学学术研讨会将于2018.11.30-12.3在南昌嘉莱特和平国际酒店4楼宴会厅召开。本次会议由中国微生物学会农业微生物学专业委员会和中国微生物学会普通微生物学专业委员会联合主办,江西师范大学生命科学学院和江西省微生物学会承办。此次会议主要就微生物基因组学的新问题、新方法以及新技术三方面展开讨论,涵盖微生物基因组编辑技术,农业、医学、工业、环境、兽医微生物基因组学及应用,合成生物学与代谢工程等议题。
未来组作为三代基因组测序中心,将携最新的第三代单分子实时测序技术前来参加本次研讨会,并展示基于ONT平台细菌基因组研究、全长16S/18S/ITS/功能基因扩增子研究、宏基因组3.0最新进展及应用成果,期待与您共同探讨微生物基因组学的新技术。

久等了!未来组携最新升级版Sequel数据前来报道

不久之前,PacBio官方宣布Sequel软件试剂再次升级(软件V6.0、试剂V3.0),性能优越,甚至实现了“长读长”和“高准确度”兼得!作为三代测序应用的探路者,新版软件试剂的测试和应用怎么少得了未来组!经过实验和生信研发团队的一番努力,最新版本Sequel数据新鲜出炉——未来组PacBio测序中心会有怎样的优异表现?一起来看看吧~
下机数据统计

未来组PacBio Sequel平台基于新版本试剂和软件(软件V6.0、试剂V3.0),产出和读长均得到了很大提升——基因组测序单个SMRT cell产出突破22.92Gb,polymerase reads 平均读长超过50Kb!

正如官方宣传数据,新版本试剂和软件在全长转录组方面的表现尤其优异——20h的运行时间,产出达到42.39Gb,polymerase reads平均长度达到59Kb,N50达到110Kb!

表1  V3.0试剂、V2.1试剂下机数据统计

下面来看一下新版本软件试剂在基因组和转录组中的具体表现~

基因组

在某植物基因组测序项目中,构建插入片段为30Kb的文库,分别使用新版的V3.0试剂、V6.0软件测序和V2.1试剂、V5.1软件测序,数据分布如下:

表2 基因组测序中V3.0试剂与V2.1试剂数据比较

图1 基因组测序中V3.0试剂与V2.1试剂subreads读长分布比较

转录组

在某昆虫转录组测序项目中,构建插入片段为0.5-6Kb的文库,分别使用新版的V3.0试剂、V6.0软件测序和V2.1试剂、V5.1软件测序,数据分布如下:

表3 转录组测序中V3.0试剂与V2.1试剂数据比较

图2 转录组测序中V3.0试剂与V2.1试剂subreads读长分布比较

武汉未来组早在2016年就已经成功搭建基于PacBio的三代测序平台,并于2017年9月成功搭建Nanopore测序平台,一直致力于第三代测序技术的应用和推广,应用三代测序的合作研究成果多次登上Nature Genetics、Molecular Plant及Nature Communications等国际知名期刊。

2018全国系统与进化植物学研讨会圆满落幕

11月26日,由中国植物学会系统与进化植物学专业委员会和系统与进化植物学国家重点实验室主办的全国系统与进化植物学研讨会暨第十三届青年学术研讨会在武汉金盾大酒店圆满落幕,本次会议专题分为四部分:植物资源调查与分类学;植物系统发生与生物地理学;植物进化发育与基因组学;新技术、新方法展示及纪念钟扬。全国各地的多位专家学者参会,分享了精彩的报告,展示了该领域的研究进展和成果。

会上,多名专家学者分享了在植物系统发育、植物进化及环境适应性等方面的研究成果。从这些研究进展报告中不难看出,基因组学、比较基因组及转录组等研究方法是揭示植物进化及系统发育机制的重要手段。

未来组生信研发部副总胡江为与会学者作了题为“Application of Long Read Sequencing Technology in Plant Genome”的精彩报告,介绍了三代测序的技术原理和技术优势,并展示了未来组在三代测序应用方面的研发进展与成果等,引发了与会学者的热烈讨论。

植物基因组比动物基因组复杂得多,其基因组普遍存在多倍性、高重复、高杂合等特点,是植物基因组测序组装的主要难点,而应用长读长测序技术可以较好地解决这些植物基因组组装难题。

本次会议是对已有的系统与进化植物学研究的一次总结与讨论,也是新征程的开始。组学君向一直奋斗在科研一线、默默奉献的科研工作者致敬!武汉未来组将会基于自身配备的长读长测序平台,依托自身的三代测序研发实力,继续在科学研究的道路上为各位合作伙伴提供助力。

未来组合作发表项目文章列表

官宣:AI上华为云

近期,如果在电梯里面看到下图,请不要惊讶——没错!未来组和华为云“在一起”了!如此高调的官宣,有没有打动你呢?

随着测序技术的飞速发展,测序成本的持续下降,基因组大数据时代已悄然到来。基因测序行业从原来的“测的没有算的快”,变为“算的没有测的快”。

你知道完成一个人类基因组的组装分析需要多少时间吗?

依靠现有测序技术,完成一个人的全基因组测序可能产生1.5T数据,运用传统IT计算能力针对这些数据进行组装注释分析,至少需6天时间。

华为云针对生物测序行业的特点,开创了独特的解决方案。

基因测序典型业务场景(图片来自华为云官方网站)

未来组目前配备Oxford Nanopore、PacBio Sequel、BGISEQ、BioNano光学图谱及Hi-C染色体构象捕获等技术和平台,月产出数据高达数十Tb,大规模的数据运算需求促成了未来组与华为云的紧密合作。

华为云协助未来组打通了线下数据生产平台与云端高性能计算平台之间的网络链路,使得线下产生的数据可以快速上传到云端,从而进行后续的分析。数据达到云端后,根据项目需求,在控制台申请足够规模的弹性云计算资源,快速完成项目。在这个模式下,目前已经可以实现在1天内完成一个人类全基因组的组装。

未来组目前承接了大量动植物基因组、转录组、微生物基因组及宏基因组测序分析等科研服务项目,在高性能运算集群的帮助下,未来组将进一步缩短项目服务周期,为合作伙伴提供更高效、更优质的测序组装及分析服务!

下一站南京 | 2018中国遗传学会

中国遗传学会第十届全国会员代表大会暨学术讨论会”将于2018年11月26-29日在江苏南京召开,这里是1978年中国遗传学会第一届全国会员代表大会召开的地方,这次中国遗传学会重归故地,回顾走过的40年历程并描绘中国遗传学领域的美好蓝图。

本次会议大会主题为“遗传学:继承、创新、发展”,届时将有来自全国的近千名遗传学相关领域的科研工作者欢聚一堂,投票选举出第十届理事会成员,并就遗传学领域的热点、难点和新成果、新进展展开讨论,会议设有植物遗传学、动物遗传学、人类医学遗传学、发育遗传学、遗传学教育与科普、表观遗传、微生物遗传、生物产业、青年论坛、神经遗传学、遗传咨询论坛、遗传与分子诊断以及科学道德与伦理等十三个分会场,规模浩大,盛况空前。同时,未来组&希望组CEO汪德鹏先生受邀参与生物产业分会场主题报告,将与与会专家学者交流本领域研究热点和第三代测序技术对遗传学领域的应用。

未来组&希望组诚邀您莅临A11号展位,我们将在会议上展示第三代测序技术(Oxford Nanopore和PacBio Sequel)最新的研发动态及其如何应用于分子育种、精准医疗等领域。想了解最新的三代测序技术进展么?快快参与2018中国遗传学会,我们将与您深入交流!

武汉未来组在国内率先引进三代测序平台,已搭建基于PacBio、Nanopore、BioNano光学图谱和Hi-C染色体构象捕获技术的三代测序基因组中心,解决了复杂动植物基因组、微生物基因组、全长转录组、微生物群体研究以及人类基因组变异检测等领域的技术瓶颈,并与高等院校和科研院所合作完成了数百个三代测序科研项目,在基因组学领域积累了丰富的项目经验。

会议链接:

http://gsc2018.jsgs.org.cn

欢迎莅临2018全国系统与进化植物学研讨会

中国遍布3万多种高等植物,占世界十分之一的多样性,植物之间的系统发育关系及起源演化一直都是聚焦研究者兴趣的重要课题。2018 年 11 月23-26 日,由中国植物学会系统与进化植物学专业委员会和系统与进化植物学国家重点实验室主办的全国系统与进化植物学研讨会暨第十三届青年学术研讨会将于武汉金盾大酒店召开。

本次会议主要讨论植物资源调查与分类学,植物系统发生与生物地理学,植物进化发育与基因组学和新技术、新方法展示,并借这次机会纪念已故中国植物学会系统与进化植物学专业委员钟扬。

会议旨在推动我国系统与进化植物学学科的发展,加强国内外同行在该领域的交流与合作,未来组也将在本次会议上和专家学者讨论与交流关于植物系统与进化研究的热点和新进展。

同时,未来组将展示最新的三代测序技术(Oxford Nanopore和PacBio Sequel)及其应用成果,为组学领域研究提供新思路。会议中未来组生信研发部副总胡江还将为大家带来“长读长测序技术在植物基因组中的应用”的报告,欢迎感兴趣的朋友们参加!

植物基因组比动物基因组复杂得多,其基因组普遍存在多倍性、高重复、高杂合等特点,是植物基因组测序组装的主要难点。武汉未来组基于三代测序平台(PacBio和Nanopore)、BioNano光学图谱和Hi-C染色体构象捕获技术,克服植物基因组中高杂合高重复的难点,已完成多种植物基因组及转录组测序项目,如木棉、杜仲、水稻、棉花、矮牵牛、玉米等,合作研究成果已有多篇发表于国际知名学术期刊。
欢迎莅临未来组展位
会议链接:http://www.whiob.ac.cn/xwdt/kydt/xshd/201810/t20181015_5142249.html?from=timeline

中草药基因组文章大盘点

中药学是我们中华民族的文化瑰宝,是世代传承的智慧结晶。《神农本草经》记录了中国365种中草药,而据统计中国有1000多种药用植物,因与国人健康息息相关,中药也成为了国民经济重要的支柱产业。随着测序技术的发展,人们逐渐可以从分子角度探究药用植物的功能基因组学、分子育种及合成生物学等领域,为开辟新的植物药用价值提供宝贵的参考。

近年来,不少中药领域的“重量级”物种的基因组信息先后被解码,如被称为“四大仙草”中的人参、灵芝和冬虫夏草;另有大麻、铁皮石斛、甘草、丹参等中药基因组相继被公布,相关研究文献也陆续发表,为中药中的有效药用成分的合成及代谢研究提供了有效工具,为中药“现代化”增添助力。

以下组学君精选三篇文献,和大家一同探讨中药基因组的研究套路
铁皮石斛基因组[1]
物种名:铁皮石斛 (Dendrobium officinale)分类:兰科 石斛属

基因组:1.35Gb

石斛属是在兰科中仅次于石豆兰属的第二大属,目前鉴别出的具有较高观赏及药用价值的种类有1000多种。铁皮石斛为石斛之极品,具有独特的药用价值,生于树上和岩石上。第一个铁皮石斛基因组文章于2014年发表在Molecular Plant上,该研究通过结合第二代Illumina Hiseq 2000测序技术和第三代PacBio测序技术,从头组装出了1.35 Gb的铁皮石斛基因组序列。该研究对铁皮石斛基因组进行注释,研究了与环境适应和共生相关的基因家族,并分析了铁皮石斛中的药用成分合成相关基因。

研究发现:兰科植物有着完整的花序基因集,并有一些相对于其他单子叶植物的特异性的花序基因;石斛中与真菌共生和抗旱性有关的一些基因家族发生了明显扩增;对药用成分合成相关基因的分析发现与多糖生成相关的SPS和SuSy基因发生了大规模复制,铁皮石斛生物碱合成信号通路从已有的研究基础上延伸到16-epivellosimine的合成。

二代测序技术(SGS)和三代测序技术(TGS)的结合有利于解决复杂基因组的组装难题。铁皮石斛的基因组数据,特别是基因家族分析结果,阐明了药用石斛的一些重要生物学特性的基因组基础,包括抗旱性、与真菌共生、兰花基因集的完整性和药用成分的生物合成等,提高对药用植物生物学的认识将最终促进中草药的现代化。

青蒿基因组[2]
物种名:青蒿(Artemisia annua)分类:菊科 蒿属

基因组:1.74Gb

青蒿是一年生草本植物,全生育期120天左右。青蒿药用价值很高,青蒿素的衍生物可生产很多系列药品,是抗疟疾化合物青蒿素的唯一天然来源。2018年3月,Molecular Plant杂志发布了高质量青蒿基因组。该研究同时结合二代测序技术(Illumina和Roche 454)和三代PacBio测序技术,组装得到的青蒿基因组大小为1.74Gb。研究者对青蒿基因组进行注释及基因家族分析,并结合转录组数据,探索青蒿素的生物合成及调控途径。

青蒿基因组高度杂合,杂合度为1.0%–1.5%,同时具有高密度的LTR重复序列。长读长测序数据的加入,跨越了这些单凭短读长技术难以逾越的障碍。通过对青蒿基因组的分析,研究者发现了871个可能为菊科植物所特有的基因家族。青蒿基因组和相关的转录数据不仅为青蒿素的生物合成途径及其调控提供了新的见解,而且也为青蒿素代谢工程研究提供了有效工具。

青蒿素的生物合成涉及多个酶促反应,这意味着可能有多个酶反应步骤限制了青蒿素生物合成过程中的代谢通量。研究者通过过表达青蒿合成途径中上、中、下游的基因,获得了转基因青蒿株系,可以明显提升青蒿素的产量,将有助于应对全球青蒿素需求增加的挑战。

罂粟基因组[3]
物种名:罂粟(Papaver somniferum L.)分类:罂粟科罂粟属

基因组:~2.72 Gb

罂粟的花朵色泽艳丽,具有极高的观赏价值。因其蒴果有致人成瘾的特点,被称为“恶之花”。而从另一个角度看,罂粟也是重要的药用植物,其提取物是多种镇静剂的来源,如吗啡、蒂巴因、可待因等。2018年8月,罂粟基因组在著名科学杂志Science上发布,一度引起轰动。该研究公布了罂粟基因组草图,组装中运用了Illumina、10X genomics及PacBio测序数据,并使用Nanopore和BAC数据辅助验证组装质量,最终contig N50 为1.77Mb, scaffold N50 为 204 Mb。

研究者将罂粟基因组与葡萄、拟南芥、阿拉伯咖啡、莲和耧斗菜等双子叶植物基因组进行比较分析,探索罂粟的演化历程。研究发现,罂粟基因组在距今780万年前发生了一次全基因组加倍事件。

罂粟基因组为研究者提供了一个可以定位与BIA代谢相关基因的机会——位于11号染色体上的一个584kb的区域内,排列着诺斯卡品基因簇、(S)- to (R)-reticuline (STORR)基因及四个吗啡生物碱合成途径相关基因,这些基因在茎中共表达合成吗啡,也称为BIA基因簇。研究发现,基因组重排在罂粟中BIA代谢的进化中起重要作用。

基因测序技术为中药的分子遗传学研究开辟了新大门,使人们得以从基因组水平洞察中药的作用机制。为了提高药用植物参考基因组质量,越来越多的研究者选择在基因组组装中应用PacBio、Nanopore、Bionano、Hi-C及10X Genomics等新技术。技术的发展推动认知进步,相信不久的将来,我们就可以用足够的科学数据支撑起中药之学。一起拭目以待吧~

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已发表中药基因组文献汇总

参考文献:[1] Yan L , Wang X , Liu H , et al. The Genome of Dendrobium officinale Illuminates the Biology of the Important Traditional Chinese Orchid Herb[J]. Molecular Plant, 2015, 8(6):922-934.

[2] Shen Q , Zhang L , Liao Z , et al. The Genome of Artemisia annua Provides Insight into the Evolution of Asteraceae Family and Artemisinin Biosynthesis[J]. Molecular Plant, 2018, 11(6).

[3] Guo L, Winzer T, Yang X, et al. The opium poppy genome and morphinan production[J]. Science, 2018.

Nature|多亏了PacBio,消灭蚊子有希望了

世界上最致命的动物是什么?答案竟然是不起眼的蚊子!不幸的是,每年因蚊子传染的疾病造成多达百万人的死亡!例如雌性埃及伊蚊,每年感染超过4亿人,传播包括登革热、黄热病、寨卡病毒以及切昆贡亚热在内的可怕疾病。
对此,科学家们能做些什么呢?
2002年,冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)基因组图谱绘制成功,成为疟疾研究领域的里程碑[1],2007年、2015年,传播登革热、切昆贡亚热等疾病的元凶埃及伊蚊(Aedes aegypti )[2]和白纹伊蚊(Aedes albopictus )[3]基因组相继问世。期间,转基因不孕不育、无精蚊子的研究层出不穷,而就在近日,由洛克菲勒大学领导的国际研究团队在《Nature》杂志上发表了高质量且重新注释的埃及伊蚊基因组[4]。该研究结合了PacBio、Bionano光学图谱、Hi-C分析、10x Genomics的Chromium linked-read测序以及Illumina的短读长测序多种手段大大升级了埃及伊蚊的参考基因组,通过锚定物理图谱和细胞遗传图谱鉴定出了两倍于已知的、引导蚊子以人类为目标、定点产卵的化学感应离子受体。基于此,该发现有助于深入了解雄性性别决定位点的大小和组成并揭示杀虫剂耐药性关联基因之间的拷贝数变异。使用高分辨率的定量性状位点和群体遗传分析,研究者定位到了新的与登革热传染能力和拟除虫菊酯抗性相关的候选基因。埃及伊蚊升级后的参考基因组将为对抗这致死疾病的媒介带来新的生物学观点和防治策略,可谓是功德一件。

埃及伊蚊基因组(AaegL5)近1.25Gb且高度重复,由于缺少高质量基因组,针对埃及伊蚊的生物学控制手段迟迟未能推进。2007年发布的AaegL3[2]基因组因不够连续,未能全部挂载到染色体水平,近期的AaegL4[5]虽组装到出了染色体长度的scaffolds,但是由于contigs太短致使gap过多。因此研究人员选择了PacBio辅以Hi-C染色体构象技术组装出了高连续性的基因组,足足缩减了93%的contigs数,且端对端地锚定到了三条染色体上。使用光学图谱和linked-read测序,研究者验证了单倍型之间的局部结构和预测的结构变异。基于RNA-seq的read匹配序列平均提升了12%,并将之前被多个contigs分离了的基因模型连接起来,且使用ATAC-seq(利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序)对临近转录起始位点比对富集增加了近两倍,依此评估出基因集的注释得到了显著提升。

研究生成了166Gb的PacBio长读长数据(约130×)并使用FALCON-Unzip进行组装,得到2.05Gb基因组(Contig N50为0.96Mb,预期基因组大小一半以上的contigs>1.92Mb)(见表1)。

表1 组装统计比较

由于组装基因组比预期要大,因此研究使用了Hi-C染色体构象技术对上述组装用到的7,790条contigs进行排序和定向,通过Hi-C数据锁定了258个连接错误的区域后,得到了混合数据生成的8,306条有序定向的contigs;然后基于重合区域通过开发的流程排除了5,440个gaps并提升连续性,将94%的测序碱基锚定到三条染色体上。随后又使用PacBio长reads进行补洞和数据打磨,得到了1.279Gb的AaegL5基因组和完整的线粒体基因组。最后,使用Hi-C连接图谱,研究者估算出了近5Mb分辨率的着丝粒位点,且1号染色体近150-154Mb,2号染色体近227-232Mb,3号染色体约196-201Mb。

图1 AaegL5组装统计和注释

较之AaegL3和AaegL4,使用BUSCO评估出AaegL5更多的单拷贝直系同源基因,片段化和丢失的基因更少,连续性显著提升,且AaegL5中有65%的转座元件和重复序列。另外,研究使用NCBI RefSeq注释流程生成AaegL5.0注释版本,为253个性别、组织、发育阶段特异的RNA-seq文库的转录本富集综合定量建立基础。和之前的AaegL3.4版本比较后发现AaegL5.0优势明显,例如在基因组尺度上map到了1.8倍于原来基因集的ATAC-seq reads以预测转录起始位点。

接下来,研究者又验证了AaegL5组装版本在碱基水平和结构上的准确度。为开发基于AaegL5精细的物理图谱,研究生成了500个BAC克隆,包含伊蚊基因组DNA及通过荧光原位杂交绘制的物理图谱,然后比较它们的组装坐标,发现物理图谱和BAC末端比对序列之间一致性达97.4%。总之,AaegL5物理图谱的基因组覆盖度达到93.5%,相较于仅有45%的AaegL3,该物理图谱是目前所有蚊子基因组中最完整的。

近期复制的基因由于序列相似性高易被归为单个基因组的等位基因,因此含有多个基因的大型基因家族往往难于组装和注释,因此研究借助升级版的AaegL5基因组和AaegL5.0注释版本分析了大型基因家族中编码蛋白酶、G蛋白耦合受体和化学感应受体的基因并鉴定到54个新的离子受体基因,几乎是已知该家族成员的两倍。对于化学感应受体完整的特征描述将有助于开发紊乱蚊子叮咬行为的新策略(见图2)。

图2 染色体排列和新增的感应受体基因数

伊蚊和库蚊的性别决定受显性的雄性性别决定因子(M factor)支配,位于M locus染色体上,这条染色体除M/m染色体组型外都是同态的,即雌性为m/m,雄性为M/m,M locus的分子机制一直未能探明。研究比对了雌雄两种个体基因组(AaegL5和AaegL4),鉴定出了包含一种名为Nix的M factor的区域,可能代表分化的M/m位点,随后又对两个基因组中M locus进行了比较分析,发现Nix包含一段100Kb的单个内含子,而紧密关联M locus的基因myo-sex则近300Kb,且M locus有超过73.7%的重复序列。研究还通过对基因组雄性特异信号区域进行定量的方法探究了性染色体之间的分化,等等。更完整的蚊子M locus组装使得同态的性别决定染色体进化和延续的研究成为可能。

图3 AaegL5用于解析性别决定位点

最后,研究者借助Illumina和10×Genomics平台来分析埃及伊蚊基因组中包含插入、缺失、易位和倒位等结构变异,重点分析了编码高度保守转录因子的Hox基因和大型多基因组家族GSTs(谷胱甘肽S转移酶家族),还通过对四个实验室克隆样本进行全基因组测序以在全基因组范围内分析埃及伊蚊的遗传多样性,并且分析了其作为登革热病毒载体的感染能力和对拟除虫菊酯(模拟天然除虫菊素的人工合成杀虫剂)的抗性。

总结
这份研究最闪光的地方在于研究者结合了PacBio、Bionano、Hi-C以及10×Genomics多个平台,不仅获取了高度连续、高分辨率的埃及伊蚊基因组,还使用了多种方法综合分析了它与化学感应离子受体相关的基因,这些基因和蚊子辨别人类气味的关键基因,对它们的定位分析可谓是开发新型驱蚊剂的第一步,而且研究还探究了其性别决定因子的关键基因,又为从源头上控制蚊子数量提供了理论支持。希望研究人员在PacBio、Nanopore、10×Genomics等平台的助力下尽快掌握蚊虫遗传控制的机理,拯救那些受疟疾、登革热、寨卡病毒困扰的人们于水生火热之中,造福人类!

参考文献

[1] The Genome Sequence of the Malaria Mosquito Anopheles gambiae[J]. Science, 298.

[2] Nene V , Wortman J , Lawson D , et al. Genome sequence of Aedes aegypti, a major arbovirus vector.[J]. Science, 2007, 316(5832):1718-23.

[3] Chen X G, Jiang X, Gu J, et al. Genome sequence of the Asian Tiger mosquito, Aedes albopictus, reveals insights into its biology, genetics, and evolution[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2015, 112(44):E5907.

[4] Matthews B J, Dudchenko O, Kingan S B, et al. Improved reference genome of Aedes aegyptiinforms arbovirus vector control . [J].Nature,2018,https://doi.org/10.1038/s41586-018-0692-z.

[5] Dudchenko, O. et al. De novo assembly of the Aedes aegypti genome using Hi-C yields chromosome-length scafolds. Science 356, 92–95 (2017).

组学君邀您“协同创新,绿色发展”

由湖南省部共建淡水鱼类发育生物学国家重点实验室、湖南师范大学和中国水产学会联合主办,长沙学院水生动物营养与品质调控湖南省重点实验室,湖南省生物发育工程及新产品研发协同创新中心、国家大宗淡水鱼产业技术体系、湖南省生物研究所、湖南省水产学会、大湖水殖股份有限公司等单位协办的“动物遗传育种及健康养殖学术研讨会”将于2018年11月16-18日在湖南长沙召开,本届会议的主题是“协同创新,绿色发展”。届时,未来组将展示以Oxford Nanopore和PacBio Sequel为代表的三代测序技术最新的应用方向和研究成果。

武汉未来组在国内率先引进三代测序平台,已搭建基于PacBio、Nanopore、BioNano光学图谱和Hi-C染色体构象捕获技术的三代测序基因组中心,解决了复杂动植物基因组、微生物基因组、全长转录组、微生物群体研究以及人类基因组变异检测等领域的技术瓶颈,并与高等院校和科研院所合作完成了数百个三代测序科研项目,在基因组学领域积累了丰富的项目经验。

附:近年鱼类基因文献汇总列表
会议链接:http://ldbff.hunnu.edu.cn/news?newsid=1152

未来组荣登2018“光谷20强”

11月13日下午,由德勤中国和武汉东湖新技术开发区管理委员会共同主办的第五届光谷高科技高成长20强暨明日之星颁奖典礼成功举办,未来组位列“光谷20强”榜单!本次活动旨在发现和表彰光谷高成长、持续创新的卓越企业,未来组的入选充分肯定了我司的良好发展态势,也有助于进一步提升品牌影响力和企业竞争力。

典礼于14:30开幕,东湖高新区管委会领导和德勤武汉办公室主管合伙人等相继致辞与颁奖,未来组首席运营官李元作为三家代表企业之一发表了获奖感言,介绍了未来组的成长历程,表示未来组的迅速成长离不开武汉市政府和东湖新技术开发区提供优渥的发展环境和政策生态,更展望了东湖高新区的美好未来。

作为武汉创新前沿阵地的光谷,生物产业在五大主导产业中营收增速最快,随着营商环境和生态体系的不断完善,我司将基于不断升级的研发投入,进一步加强和完善人才队伍结构,加快新产品和服务开发的脚步,进一步扩大营销市场,创建生物测序行业国际化的新高地。

武汉未来组拥有PacBio、Oxford Nanopore、MGISEQ、BioNano光学图谱及Hi-C染色体构象捕获等技术和平台,同时在华为云、天河二号及阿里云上搭建高性能集群用于生信分析,为高等院校和科研院所提供动植物基因组、全长转录组、表观基因组、微生物基因组、宏基因组和结构变异检测等领域的科研服务,已完成了数百个三代测序科研项目,合作发表了一系列高质量的三代技术文章。未来组致力于打造世界领先的三代测序基因组中心,在承诺高标准交付指标的同时将进一步大幅压缩项目服务周期,为合作伙伴提供完善的基因测序分析服务。