庆五一，迎开学，希望组三代测序感恩大回馈！

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庆五一迎开学,希望组三代测序感恩大回馈！

风雨洗礼后的中华大地生机无限，史上最长寒假也终于接近尾声，全国各地高校陆续发布了师生返校安排。自疫情发生以来，全国人民精诚团结，倾力支援武汉，谱写了中华民族一首首感人肺腑的诗篇！作为一家位于湖北武汉的科技服务型公司，我们也感念于全国客户多年以来的大力支持，借此机会，希望组科技服务正式开启“感恩回馈，服务增值”活动，回馈全国高校、科研单位老师同学，让科研基金尽其所用，助力您的新学期科研工作加速开展！

活动详情咨询当地科技顾问，或邮件联系sales-support@grandomics.com，希望组科技服务，为您的科研之路保驾护航！

让生命充满希望！——“希望组”“未来组”品牌整合

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2011年8月，我在武汉创立了“武汉未来组”。当时的想法非常简单，从华大基因出来，不偷老东家的“一行代码、一个产品、一个人、一项技术”，独立创业，如果能活着就继续做，如果不行就转行做会计，反正之前还考过注册会计师，注册税务师，应该不难。“未来组”品牌的寓意是：持续推动新的组学技术的发展，一直引领新的组学技术的应用，不停创新，从而创造价值。
2012年10月，我们选择了将“三代测序”作为我们主要的战略方向，从而成为了中国首家三代测序服务公司。从细菌、线粒体、叶绿体基因组完成图开始，逐步拓展到真菌近完成图和动植物基因组精细图，一直到人类基因组高质量参考基因组，我们将基因组组装的技术极限不停的推向前沿，也带动了整个领域的变革。看到现在基因组组装领域，已经基本上完全被三代测序所垄断，当时还是不曾预计到的，这只是三代测序技术基本取代二代测序技术的第一个应用领域，以后也许还会有更多。
2014年，我们成立了“北京希望组”，准备开始涉足精准医学领域，继续拓展三代测序的应用场景。这一次，基本上是在一个无人之境探索，整个世界都没有真正意义上的三代测序精准医学产业，零星的三代测序医学研究已经开始，但是远不是主流。在目睹了一个病友家庭历时七年、为了一种罕见病（多囊肾）的诊断和产前诊断，求医问药，历尽艰辛之后，最后因为我们是三代测序公司而找到了我们，我受到了强烈的震撼，原来疾病可以让人如此的绝望，原来测序技术是可以如此的改变人生，造福人类。“希望组”品牌由此而生，我们想用最新的技术，解决难以解决的问题，从而“让生命充满希望”。
接下来几年，我们一边继续拓展三代测序在动植物领域的应用：开发了NextPolish和NextDenovo系列软件，在国内三代测序基因组组装也算是唯一的拥有自主开发组装软件的公司；引进了Oxford Nanopore技术平台大幅进入动植物组装领域，因为ONT技术的高通量、低成本，大大拓展了动植物基因组组装项目的效率，随着ONT技术的成熟和成本的进一步降低，ONT组装动植物基因组已经成为很多实验室自建平台，独立开展动植物基因组研究的最佳选择。在此基础上，我们又进一步基于ONT平台的Ultra-long Reads技术进行探索，再结合PacBio Sequel II的HIFI Reads技术、Bionano光学图谱、Hi-C技术，将动植物基因组组装也提高到了“近完成图”标准，即将在近期开始推广。
另一方面，我们在三代测序精准诊断领域，也一直在不停的探索与积累：借助PacBio Sequel技术平台，拓展了HLA分型和遗传病诊断Panel的应用，借助Bionano Genomics平台，我们开发了面肩肱肌肉营养不良（FSHD）的精准诊断技术，借助Oxford Nanopore技术平台，我们开发了遗传病诊断、病原微生物快速诊断、辅助生殖诊断技术以及肿瘤基因组诊断Panel，可以说已经全面覆盖了精准医学的方方面面。
然而，无论客户、投资机构、政府部门等行业内外相关者，都对于我们两个品牌感到困惑，让我产生了整合品牌的冲动，尤其是以下一些缘故：
1）2019年有一天，无意中看到一个同行公司的宣传：他们在Nature Index上面行业排名领先，技术如何好，市场如何好，但是，我突然发现原来我们的指标如果把未来组与希望组加起来，其实超过了这家行业领导公司。看起来，原来连Nature也不知道我们“未来组”与“希望组”是一家啊！看起来，我们两个品牌”NextOmics”和”GrandOmics”的分隔，在国际上也引起了困惑。
2）2019年，作为中国的一件大事，就是“香港事件”。期间我一直在思考，为什么会有这样的结果，当然原因有很多，其中一个重要的原因，我个人觉得就是品牌不统一，大陆是“中国”品牌，香港是“香港”品牌。我再看我们自己公司，其实也是一样，一部分是“未来组人”，一部分是“希望组人”，其实也是不统一的，这样的事情，改变一个国家的治理，不是很容易，但对于一个公司来说，还是可以很快调整的。
3）2020年，大家都经历了一次非常魔幻的开局，还没有来得及大干一场，一年的1/4就这样匆匆而过，我们作为发源于武汉，主要的生产基地都在武汉的公司，也积极的投入到了抗疫的工作之中，协助火神山、病毒所等多个单位进行紧急的科技攻关。疫情给我们带来了极大的困难，也给我们带来了难得的机遇，让我们崭露头角，我们趁此机会与301医院一起，开发了借助Oxford Nanopore技术平台的病原微生物快速诊断与生物信息分析平台，大量的成果即将逐步公开。但是，在参加抗疫的过程中，我们感觉很多来自于全国各地的援助国家医疗队也是对我们未来组与希望组两个品牌感到困惑，让我再一次感到了品牌分隔的压力。

疫情之后，一切都改变了。

也许这是一个要改变人类生活方式，生产方式，合作方式的“大历史”事件。

武汉在重启，我们公司也在重装，整个公司将更加聚焦技术创新、应用落地、服务客户、创造价值。为了更好的传递公司的战略、价值观与技术创新，我们在今天：2020年4月13日，正式启动“希望组”与“未来组”品牌统一的工作。以后，将统一使用“希望组”品牌，用于我们的“科技服务”、“诊断服务”、“生物信息”、“诊断产品”四大业务模块。“未来组“品牌将暂时保留到以后的其他业务模块之用。
特作文以记之。汪德鹏

2020年4月13日于武汉

武汉希望组医学检验实验室满分通过全国新型冠状病毒核酸检测室间质量评价

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近日，国家卫生健康委临床检验中心公布全国新型冠状病毒核酸检测室间质量评价结果，武汉希望组医学检验实验室满分通过，并获得室间质评合格证书。

关于全国新型冠状病毒核酸检测室间质量评价

核酸检测是新型冠状病毒肺炎（Corona Virus Disease 2019，COVID-19）确诊的重要手段，为了解我国新型冠状病毒（2019 novel coronavirus， 2019-nCoV；国际病毒分类委员会将2019-nCoV命名为SARS-CoV-2）核酸检测的开展现状及质量状况，帮助临床实验室发现检测中存在的问题并进行改进，使得核酸检测在疾病防控工作中更好地得到应用，国家卫生健康委临床检验中心于2020年3月开展了新型冠状病毒核酸检测室间质量评价。本次“全国新型冠状病毒核酸检测室间质量评价”主要评价实验室对新型冠状病毒核酸检测的能力，重点考察实验室检测的分析性能，包括分析敏感性和分析特异性。

 

室间质量评价（EQA，external quality assessment），是多家实验室分析同一标本、并由外部独立机构收集和反馈实验室上报的结果、以此评价实验室操作的过程。通过实验室间的比对判定实验室的校准、检测能力以及监控其持续能力。室间质量评价是国际公认的临床实验室全面质量管理的重要组成部分，也是世界上多数国家临床实验室行政管理和实验室认可的基本要求。

武汉希望组医学检验实验室满分通过全国新型冠状病毒核酸检测室间质量评价，证明了武汉希望组新冠病毒核酸检测结果的可靠性、稳定性，有能力为一线抗疫提供高效精准的核酸检测筛查。同时，武汉希望组正在开发基于纳米孔测序技术的冠状病毒全基因组检测技术，与基于qPCR的技术形成有力互补，为疫情防控提供关键技术支持！

希望组与Bionano合作开展COVID-19感染患者基因组变异研究

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Bionano 将用于鉴定导致冠状病毒疾病易感性的基因变异的研究

第一项研究将在中国武汉进行；欧洲和北美的研究有望紧随其后

圣地亚哥，2020年3月10日（全球新闻）-Bionano Genomics宣布启动COVID-19感染患者基因组变异的全球研究网络，本研究旨在确定影响COVID-19疾病抵抗力，敏感性，疾病进展和药物反应的基因组变异。第一项研究将在中国武汉进行，Bionano服务提供商希望组将与Bionano Genomics合作开展。至少有100名COVID-19感染检测呈阳性的患者将使用Bionano Saphyr系统进行全基因组分析，并将比较无症状或轻度症状的患者和有严重疾病的患者的基因组变异。这项研究将控制病毒株的差异，以及已知的年龄和慢性疾病的危险因素，如心脏病、糖尿病或其他影响免疫系统的疾病。
Bionano Saphyr系统在极长的基因组DNA分子上标记荧光并成像，以识别结构变异。尽管Bionano的技术并不适合于病毒检测本身（通常通过PCR测定进行检测），但Saphyr能独特的检测人类基因组中的结构变异。这种变异可能使个体易于出现轻微或严重的疾病进展，或对病毒具有抗性。此外，某些变异可能决定个体对药物治疗的反应。
基因组变异与疾病抗性和疾病进展的关系已在多种传染病中得到证实。α-球蛋白基因的缺失会导致镰状细胞性贫血，但可以预防疟疾感染。CCR5基因中的一个结构变异提供了针对艾滋病病毒感染的保护，这一发现导致一些患者被治愈，他们接受了来自携带这种变异的捐赠者的骨髓移植。在IL28B位点的遗传变异使携带者在药物治疗后根除丙肝病毒的机会比那些没有这种遗传变异的携带者大3倍。主要组织相容性复合体（MHC）位点（约有150个基因的基因簇）的结构变异与对多种传染病的抗性有关。Saphyr可以对人MHC位点的等位基因进行特异的分析和分相。
最近的研究表明，COVID-19和SARS-CoV（导致SARS爆发的冠状病毒）都与血管紧张素转化酶2（ACE2）基因相结合从而进入细胞。Bionano研究将探究ACE2周围区域可能影响病毒结合的结构变异和拷贝数变异，分析患者的MHC区域，并使用Saphyr无偏倚的全基因组范围检测能力，试图找到尚未确定的疾病易感性基因。专家们一致认为，对宿主反应范围的调查对于确定如何最好地抗击该疾病并防止今后爆发类似性质的疾病至关重要。
Bionano Genomics首席执行官Erik Holmlin博士表示：“作为一家在结构变异检测方面处于领先地位的生命科学公司，我们相信，我们有责任帮助阻止这一致命的毁灭性的流行病。Bionano的基因组成像技术比任何基于测序的方法都能更好地识别基因组结构中的变异，这使我们处于独特的位置，可以帮助识别基因组中的变异，从而保护患者免受病毒感染或使其易于感染。我们已经在全球范围内开展了识别这类变异的研究，并很高兴地宣布将在最初的疫情中心武汉开展的这些研究中的第一项。我们计划将这些发现提供给科学和公共卫生界，并希望我们能够为疫苗或药物开发、更好的患者分流和治疗以及疾病和流行的全面管理做出贡献。”
希望组首席执行官汪德鹏表示：“我们很高兴与Bionano合作，将Saphyr用于这项重要研究。由于我们在武汉设有临床实验室，因此GrandOmics与COVID-19战斗的前线的临床医生和研究人员有着独特的联系。我们收集的患者样品越来越多，具有涵盖一系列结果的全面临床历史。我们相信，该样本库与Saphyr的独特能力结合在一起，将为疾病当前的爆发以及未来的潜在爆发提供深刻的见解。”
关于Bionano Genomics
Bionano是一家基因组分析公司，基于Saphyr系统向从事基因研究和患者测试的科学家和临床医生提供工具和服务。Bionano的Saphyr系统是用于超灵敏和超特异结构变异检测的平台，使研究人员和临床医生能够加快寻找新的诊断和治疗靶标的速度，并简化染色体变化的研究，这被称为细胞遗传学。Saphyr系统由仪器，芯片耗材，试剂和一组数据分析工具以及基因组分析服务组成，Bionano数据可通过使用Saphyr或通过遍及全球的检查服务获得。更多信息，请访问www.bionanogenomics.com。
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Bionano安全港声明
本新闻稿包含1995年《私人证券诉讼改革法案》所定义的前瞻性陈述。诸如“可能”，“将”，“期望”，“计划”，“预期”，“估计”，“打算”等词语。”和类似的表述（以及引用未来事件，条件或情况的其他词语或表达）传达了未来事件或结果的不确定性，旨在识别这些前瞻性陈述。前瞻性陈述包括关于我们的意图，信念，预测，前景，分析或当前期望的陈述，其中包括有关本新闻稿中讨论的研究的设计和结果，在这些研究中计划使用Saphyr以及Saphyr的贡献对COVID-19的研究，以及潜在的见识和我们的能力对疫苗或药物开发的贡献，更好地对患者进行分类和治疗，以及对COVID-19大流行进行全面管理。这些前瞻性陈述均涉及风险和不确定性。实际结果或发展可能与这些前瞻性陈述中预测或暗示的有重大差异。可能造成这种差异的因素包括Saphyr可能无法达到预期效果的风险；可以预防或防止患者受到病毒感染的基因组变异可能未被发现；在我们的研究结果发布之前，可能已遏制了COVID-19大流行；引入竞争产品；我们获得足够资金以资助我们的努力的能力；以及与我们的业务和财务状况有关的风险和不确定性，包括我们向美国证券交易委员会提交的文件中所述的风险和不确定性，包括但不限于我们截至2018年12月31日止年度的10-K表年度报告以及我们随后向美国证券交易委员会提交的其他文件佣金。本新闻稿中包含的所有前瞻性陈述仅在做出陈述之日讲，并基于该日管理层的假设和估计。无论是由于收到新信息，未来事件的发生还是其他原因，我们都不承担公开更新任何前瞻性陈述的义务。2018年以及我们随后向美国证券交易委员会提交的其他文件中。本新闻稿中包含的所有前瞻性陈述仅在做出陈述之日讲，并基于该日管理层的假设和估计。无论是由于收到新信息，未来事件的发生还是其他原因，我们都不承担公开更新任何前瞻性陈述的义务。2018年以及我们随后向美国证券交易委员会提交的其他文件中。本新闻稿中包含的所有前瞻性陈述仅在做出陈述之日讲，并基于该日管理层的假设和估计。无论是由于收到新信息，未来事件的发生还是其他原因，我们都不承担公开更新任何前瞻性陈述的义务。

*本文基于Bionano Genomics公司官方网站新闻”Bionano Genomics Will Be Used in Research Identifying Gene Variantsthat Contribute to Coronavirus Disease Susceptibility”翻译。

疫情防控利器——希望组全长新型冠状病毒（2019-nCoV）试剂盒研制成功，实时监控病毒演化与变异即将成为现实

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2019年12月，武汉出现不明原因肺炎，2020-01-12日，世界卫生组织正式将造成此次疫情的新型冠状病毒命名为“2019新型冠状病毒（2019-nCoV）”。近一个月来肺炎疫情发展迅猛，截至2020-01-30 24:00 全国已确诊患者9692例，疑似患者15238例，而作为疫区核心的武汉已有2639名确诊病例（数据来源：人民日报）。
疫情的蔓延，让我们心急如焚，作为国内首家基于第三代测序技术的精准医疗公司，尤其是作为一家武汉本地企业，我们也热切的期待能贡献自己的一点点微薄的力量。公司在疫情爆发期间动员了核心研发团队，紧急攻关，开展基于第三代单分子新诊断技术的研发。疫情爆发之后，国内众多精准医疗同行纷纷紧急动员，彻夜奋战，研发出各种基于RT-PCR（和胶体金试纸）的检测技术以及产品，大大缓解了疫情初期新冠状病毒检测通量的压力，对新冠状病毒的传播和控制做出卓越的行业贡献。我们和所有同行一样心系人民的健康，同仇敌忾，团结奋战，共抗病毒。打好病毒歼灭战，不仅需要对已知病毒进行的检测，更重要的是从源头进行防控，这包括对病毒演化和变异以及对其他已知和未知的致病病毒和细菌进行机动和实时的监控和研究。这通常是疫情战役最容易忽视和遗漏的一环。为此，我们的研究团队充分利用第三代单分子测序技术的优势，将重心放在以下几点：
1. 病毒的实时检测和分析2. 利用5G技术支持临时隔离区域或者机动实验室进行云计算检测和分析

3. 开发基于全长基因组的病毒演化和变异检测技术

截止2020-01-30日，我们终于完成了基于纳米孔测序技术的新型冠状病毒（2019-nCoV）核酸全长检测试剂盒，以及基于纳米孔测序技术的宏基因组病原体检测方法。
该试剂盒采用多重PCR对病原体核酸进行扩增后使用纳米孔测序仪进行测序，将得到的核酸序列与已知病原体序列对照确定病原体类型。纳米孔测序技术克服了传统NGS测序平台对样本制备、场地要求、运行时间长等限制性特点，具备实时、长读长、运行时间短、文库构建简单等优势。宏基因组病原体检测方法能够对快速演化的病原体以及其他未知的病原体进行检测。

我们和华为5G和华为云团队一起完成了实时机动的测序数据的上云传输和计算实验，能够确保在没有固定IT基础设施的临时区域或缺少有线网络和本地计算资源的地点能够通过无线网络进行病原体的检测和分析。

目前，新冠状病毒防控已经处于非常关键的时期，除了要快速、及时、高效的对疑似病例进行确诊以外，一个不容忽视的防控方向是进行病毒演化和变异的监控，希望组新试剂盒和宏基因组检测技术的推出，可以在疫情防控的关键阶段，提供非常重要、关键的技术支持。

希望组武汉测序中心通过ISO9001：2015质量管理体系认证

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2020年1月6日，SGS授予希望组集团旗下武汉未来组生物科技有限公司（以下简称希望组武汉测序中心）证书，证明其在提供高通量测序和生信分析服务领域正式通过ISO9001：2015质量管理体系认证。
为了向客户提供持续满意的服务，实现全面的质量管理。希望组武汉测序中心从年初开始筹备ISO9001质量管理体系的建立，并于7月11日按照GB/T 19001-2016/ISO 9001:2015体系要求发布实施质量管理体系程序文件，规范公司产品服务、过程质量控制、持续改进等工作。经过近半年的运行，12月26日迎来了SGS评审专家小组，审核小组专家深入公司领导层、营销中心、项目部、生产部、生信部、IT中心、采供部、人事行政部等相关部门，对公司ISO9001质量管理体系的建立、运行情况进行了审核。
 
经过两天的现场审核，审核小组对希望组武汉测序中心ISO9001质量管理体系的建立、运行进行了综合评价。审核组专家认为，希望组武汉测序中心的管理、检测及服务全过程质量管理体系运行良好，密切关注客户需求，不断向全体员工贯彻过程质量控制的重要性，能有效降低风险并稳定地为客户持续提供满意的服务，提升客户满意度。公司在质量方针提供的框架下，在相关职能和层次上建立了质量目标，能够体现对产品和服务质量的追求，各项质量目标基本实现，满足GB/T 19001-2016/ISO 9001:2015的基本要求。
2019年12月27日，希望组武汉测序中心顺利通过SGS专家的现场评审。2020年1月6日，希望组武汉测序中心正式获得《ISO9001：2015质量管理体系认证证书》。
ISO9001认证强调以客户为中心的理念，明确公司通过了解客户的要求，通过体系中各个过程的运作满足客户要求甚至超越客户要求，并通过客户满意度的调查来获取客户的满意程度，以不断提高公司在客户心中的地位，增强客户的信心。
ISO9001质量管理体系的有效运行和认证通过，将有力促进希望组三代测序服务质量的提升，我们也将继续以更高的要求，不断完善质量管理体系，为客户创造更高的价值！

云 +AI 赋能三代基因测序，希望组荣获华为云年度峰会“选择不凡奖”

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1月8日，“选择不凡 华为云年度峰会2020”在北京钓鱼台国宾馆盛大开幕。此次峰会，华为携手各领域众多合作伙伴，共同探讨“云+AI+5G”技术融合如何成为开启智能经济的技术使能密码，实现共创共享共赢，推动数字经济进入一个崭新的智能时代。希望组作为华为基因测序领域合作伙伴，荣获“选择不凡奖”。
 
作为目前应对遗传疾病最有效的手段之一，基因测序的落地应用，为更多家庭带去了新希望，但随着基因测序技术的不断更新迭代，海量基因数据的挖掘、存储、分析等都成了测序企业的巨大考验。以人类基因组为例：23对染色体，31.6亿个碱基对，一次30倍的全基因组测序的数据量大约200Gb，基因转换、拼接、对比、注释全流程，用一台高性能服务器运行耗时30多个小时。数万/数十万个基因测序任务，对网络、存储、算力及业务响应的及时性、可靠性、安全性有极高的要求。
 
为解决面临的问题，2018年12月6日，希望组&未来组与华为深度交流并签署战略合作协议，发挥华为云在计算、存储、网络等领域的技术优势，利用希望组&未来组三代测序平台和产品，努力攻克技术壁垒，通力打造适用三代测序技术的智能化平台。

经过近一年的充分沟通、探讨和测试，2019年11月14日，希望组与华为云共同打造的精准基因组分析容器化解决方案架构 Hanwell正式发布，Hanwell 在实践中有得天独厚的优势，该方案具备的多引擎接入、高性能容器批量计算等特点 , 更好地解决了大规模群体基因组分析所面临的困难，让资源控制更加精细化。同时整个解决方案还提供了资源审计、项目监控和资源管理三个功能，比传统的 HPC 的方案耗时减少了 20%、成本下降了 30%。
得益于希望组—华为云基因测序计算平台提供的计算支持，在医学领域希望组已建立最大的中国人群全基因组结构变异数据库—dbSV100K，库内样本数量已超过 gnomAD ( 全球最大的变异数据库 )东亚人群样本数。该数据库将为挖掘基因组结构变异对人类疾病影响提供可行的机遇，以期最终提供临床基因诊断服务。
希望组与华为云的强强合作，开启了用信息技术探索基因奥秘的新篇章，用技术的温度为人类和社会带去积极改变，让未诊断的被诊断，让生命充满希望！