《Scientific Reports》武汉大学药学院携手武汉未来组揭秘PT修饰生物学功能

近期,武汉大学药学院王莲荣与陈实教授课题组与武汉未来组合作,在DNA磷硫酰化修饰(PT修饰)的生物学功能研究方面取得突破性进展,其研究成果发表在scientific reports上。

DNA磷硫酰化修饰即硫原子取代了DNA上磷酸骨架上非桥联的氧原子, 该修饰是他们前期与邓子新院士和Peter Dedon教授发现的DNA骨架上的新型修饰。早期研究发现,该种修饰在有dndABCDE基因簇的细菌中存在,而dndFGH基因簇则能保护细菌免受外源无PT修饰的质粒的迫害,然则并不是所有的细菌都同时有以上2种基因簇。基于此,他们认为PT修饰还具有除R-M系统之外的其它功能,王莲荣与陈实教授课题组采用RNA-Seq的方法对PT修饰的生物学意义进行研究。

研究将无PT修饰的菌株(dndBCDE缺失)与野生型菌株进行对比,发现无PT修饰的菌株中有89个显著高表达的基因及95个低表达基因。其中,高表达基因有些是SOS相关基因、噬菌体相关基因,综上,他们认为无PT修饰的菌株DNA遭到了破坏,进一步研究证实无PT修饰导致了DNA双链的断裂。

图1 XTG102(dndBCDE缺失)、XTG103(dndB-H缺失)、XTG104(dndF缺失)与野生型表达差异图。红色,上调;绿色,下调

参考文献

Rui Gan1* X W, 2*, Wei He1, Zhenhua Liu3, Shuangju Wu1, Chao Chen1, Si Chen1,Qianrong Xiang1, Zixin Deng1, Dequan Liang3, Shi Chen1 & Lianrong Wang1. DNA phosphorothioate modifications influence the global transcriptional response and protect DNA from double-stranded breaks [J]. SCIENTIFIC REPORTS,2014

未来组生物获得高新技术企业认证书

近日,武汉未来组生物科技有限公司收到由湖北省科学技术厅、湖北省财政厅、湖北省国家税务局、湖北省地方税务局联合颁发的《高新技术企业认证书》 ,认定武汉未来组生物科技有限公司为高新技术企业,发证时间:2014年10月14日,有效期3年。高新技术企业是发展高新技术产业的重要基础,是调整产业结构、提高国家竞争力的生力军,在我国经济发展中占有十分重要的战略地位。

武汉未来组生物科技有限公司是一家从事第三代基因测序的数据分析公司,作为国内首家提供第三代基因测分析服务的公司,未来组生物已经积累了大量的三代测序项目经验,这些第三代测序项目涵盖了动植物基因组、微生物基因组、转录组等多个组学研究领域。未来组参与完成的杜仲基因组项目,使用了第三代测序技术,该项目新闻发布会也于2014年11月下旬在北京成功召开,成果得到了行业内的充分肯定。这次《高新技术企业认证书》的获得也是政府各级部门对武汉未来组生物科技有限公司在这一领域所发挥出的推动作用的肯定。未来,未来组生物将继续秉承“新技术、心服务”的企业精神,紧跟科技前沿,创新组学研究思路,希望能为广大科研工作者提供最高效的组学解决方案。

未来组发起“万种细菌基因组完成图计划”

细菌基因组完成图在研究病原菌的致病性与疾病的预防和治疗方面,鉴定致病相关基因、开发和研究药物,疫苗、开发新型抗生素等方面具有非常重要的应用,并且它在研究细菌进化,生理和生态多样性,种内进化关系也有非常明显的优势。另外,与表观遗传学调控和DNA损伤相关的DNA碱基修饰(如甲基化)在多个生物进程中扮演了重要角色,包括生长和衰老、免疫、细菌致病性以及疾病发展。

第三代测序技术( PacBio RS II平台) 因其超长读长、极小的GC偏向性,能够快速、准确的实现细菌基因组完成图的组装,更加准确的检测结构变异,同时还能检测出全基因组、单碱基水平的表观修改信息。与一代测序、二代测序技术相比较,三代测序技术具备明显的优势,已经成为了细菌基因组、表观基因组研究的“金标准”。

未来组生物作为中国首家第三代测序服务公司,在利用三代测序技术在细菌基因组、表观基因组领域,积累了丰富的经验,构建了强大的技术团队,部分成果即将在国际一流的杂志上发表。

未来组应邀将参加 “2014年中国微生物学会学术年会”,该大会由中国微生物学会主办,哈尔滨工业大学和黑龙江省微生物学会共同承办,于2014年8月15-19日在黑龙江省哈尔滨市举行,本次大会的主题为“微生物与生态文明”,未来组很荣幸收到主办方的参会邀请。

在该会议上,我们将发起“万种细菌基因组完成图计划”,我们计划在3-5年内,绘制完成万种细菌基因组的完成图及表观修饰图谱。这个宏伟的前瞻性计划,期待您的加入!对于会议现场签约的客户,我们将有巨大的优惠活动,期待您的参与!