未来组–通过Nanopore官方测序服务认证
2018年1月17日，武汉未来组生物科技有限公司已通过Oxford Nanopore Technologies Limited（牛津纳米孔技术有限公司，ONT）官方认证，获得Nanopore DNA测序认证服务供应商资质。
未来组于2017年9月开始搭建Oxford Nanopore测序服务平台，目前已配备有11台GridION X5和2台MinION测序仪，约4个月的时间内已完成牛津纳米孔测序数据产出＞2Tb，所有数据达到官方标准，符合交付指标。后续会陆续购入通量更高的PromethION测序仪，致力于为合作伙伴提供高质量、超快捷的基因组学研究测序服务。同时其母公司希望组作为三代测序精准医疗公司，也将基于更高通量的Oxford Nanopore平台，为临床研究和应用提供更快速、更精准的解决方案。
截止到2018年1月17日，未来组Oxford Nanopore测序服务平台已完成＞20个动植物物种的纯测序，并对其中4个物种进行了基因组组装，基于Oxford Nanopore的超长读长，填补了这些物种过去没有参考基因组的空白，或者对二代参考基因组组装指标有了至少100倍的提升。
未来组Nanopore组装案例展示-某昆虫
基因组Survey
基于K-me分析预估该昆虫基因组大小为～330Mb。
Nanopore测序
提取合格的样本DNA，在Oxford Nanopore GridlON X5平台测序30Gb三代数据，最长读长达270Kb,reads N50长度达26.8KB。长读长是后续进行更准确基因组组装的前提。
基因组组装
利用多种软件进行基因组组装，配适最优方案。
基于超长读长的Nanopore测序和搭配的超算平台，让基因组组装更连续，更快捷。
本案例中，该昆虫基因组组装Contig N50能＞7Mb，已达到昆虫模式动物果蝇的组装水平。
未来组多年来专注于三代基因组学研究，经过长期积累，动植物基因组学项目经验丰富，研究成果相继发表：第一个亚洲人参考基因组（三代）、第一个水稻近完成图（三代），第一个萤火虫参考基因组（三代）、第一个药用木本植物杜仲参考基因组（三代）。在2018年国际动植物基因组学大会（PAG XXVI）上，未来组还展示了已知基因组最大的物种-重楼百合（基因组大小~152Gb）进行基因组学分析的结果，引起诸多关注。
未来组将持续扩大Oxford Nanopore测序平台，打造包含三代单分子测序、光学图谱、三维基因组学等多方位的组学研究中心，还将在RNA直接测序、表观转录组学等领域进行深度的探索。其母公司希望组将凭借未来组在科研领域的深耕积累，挖掘Nanopore技术在复杂疾病的检测应用，实现“用新技术让复杂疾病的诊断更简单、更精准”。
延伸阅读
未来已来，Oxford Nanopore全球最大测序中心落户中国
Nature methods丨基于Nanopore的direct RNA测序方法测评
来自Nanopore测序的2个线虫基因组，解析复杂的染色体重排
发表评论
想参加讨论吗？请尽情讨论吧！