2018年4月22日晚，在2018昆虫基因组与绿色防控大会上，中国农业科学院深圳农业基因研究组所发起，联合浙江大学、西南大学等单位，共同推出“TOP1000昆虫基因组计划”。该计划旨在完成主要的1000种昆虫基因组图谱绘制，促进我国昆虫学研究的深入，加强昆虫基因组学领域的交流和合作。未来组将提供三代长读长高通量测序分析助力该计划。 阅读更多

第一届亚洲演化生物学大会（The 1st AsiaEvo Conference）将于2018年4月18-20日在中国深圳召开。这是首次在亚洲组织的以演化生物学为中心，辐射比较基因组学、发育生物学、古生物学、系统生物学、生态学、生物地理学等多个研究交叉领域的综合性学术会议。未来组将在会议上展示最新的三代测序技术（Oxford Nanopore和PacBio Sequel）及其应用成果，为组学领域研究提供新思路。

部分受邀演讲嘉宾

Jacobus J. Boomsma

哥本哈根社会演化中心（CSE）主任，丹麦皇家科学院院士，著名演化生物学家，在行为生态学，性选择和性别对抗，社会性昆虫，及共生生物演化等作出重要贡献。

Scott V. Edwards

哈佛大学教授,美国艺术与科学学院院士，美国国家科学院院士，主要从事地球生命的演化和生物多样性的研究。其课题组主要以鸟类为模型，研究物种形成、生物地理学、及基因组演化和适应过程的模式。

Jenny Graves

La Trobe大学教授，澳洲科学院院士。以澳洲特有的哺乳动物为研究对象揭示高度保守的遗传物质和演化过程，在哺乳动物基因组的构成与演化方面做出了很多有影响力的工作。她曾因“人类Y染色体正在消失”的预测而著名。

Shigeru Kuratani

神户RIKEN研究院研究员，演化发育生物学家。其课题组以多种非模式生物为对象，研究咬颚，颈部，龟甲等脊椎动物形体构造的演化发育机制。

Randolph Nesse

演化医学的创始人之一，以演化生物学的观点解释、预防和治疗疾病。他的研究范围从神经内分泌反应到应激反应，以演化分析解释问题。致力于建立演化生物学作为医学和公共卫生研究领域的基础科学。畅销书《我们为什么生病》的作者。

Naomi Pierce

现任哈佛大学教授，哈佛大学比较动物学博物馆鳞翅目馆长。主要从事生态与物种演化相互作用的研究，并在使用分子进化史对生命的历史演变和生物地理分布进行比较研究。曾获得富布莱特奖学金，麦克阿瑟奖，是AAAS（美国科学促进会）和哈佛大学院士协会的成员和最高级成员。

Rasmus Nielsen

加州大学伯克利分校计算生物学教授。提出多种经典基因组数据统计和计算方法，是国际上最重要的群体遗传学专家之一。

徐星

中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员，1992年以来一直从事中生代恐龙化石和地层学研究，2001年国家杰出青年基金获得者。发表60余篇论文，其中14篇第一或者通讯作者论文于英国《自然》杂志。

杨子恒

英国皇家科学院院士，现任英国伦敦大学学院(UCL) RA Fisher统计遗传学讲座教授，RA Fisher计算生物学中心主任。主要从事分子演化、分子系统学、群体遗传学、生物信息学、计算统计学方面的研究工作，提出用于分析分子水平上演化过程的统计模型和计算算法，对分子系统学的成熟作出重要贡献。他开发的PAML软件被广泛使用。

张亚平

现任中国科学院副院长、中国科学院昆明动物研究所研究员。分子演化生物学和保护遗传学家。中国科学院院士，第三世界科学院院士。已在SCI刊物发表论文二百多篇，先后获国际大奖“生物多样性领导奖”、中国青年科学家奖、中国青年科技奖、香港求是科技基金会“杰出青年学者奖”、何梁何利基金科学与技术进步奖等奖项。

李文雄

美国科学与艺术研究院，美国科学院，台湾中央研究院院士。芝加哥大学演化生态学系James Watson终身教授，台湾中央研究院基因组研究中心研究员。 李文雄教授撰写的分子演化教科书为全美经典演化教科书，其课题组在分子钟，基因重复，灵长类视觉基因，中性演化理论等各个方向有影响深远的贡献。

张建之

密歇根大学生态与演化学系终身教授。其研究团队在同源基因演化，分子适应，人类和灵长类演化的遗传基础以及脊椎动物感觉基因演化方面做出了重要贡献。研究主要以出芽酵母以及其近缘物种为研究材料，对遗传系统中重要的功能和演化的经典现象背后的基因组模式和分子机制进行研究。曾任分子生物学与演化学会(Society for Molecular Biology and Evolution)主席。

罗哲西

芝加哥大学有机体生物学和解剖学系教授。主要从事早期哺乳动物的起源与演化，包括哺乳动物的起源、适应性和发展模式方面以及中生代哺乳动物主要类群的亲缘关系及它们的生态多样化方面

DNA测序技术及生物信息技术的发展为物种的起源和进化研究提供了有力的科学依据，获得高质量的参考基因组将会极大的延展研究者在研究对象的遗传多样性上的认识，进一步揭示物种之间的进化关系。未来组早于2016年创建了PacBio Sequel基因组学中心，并在2017年9月建成Oxford Nanopore测序中心，是亚洲第一个获得Nanopore官方资格认证的测序服务供应商。目前拥有PacBio Sequel、Oxford Nanopore、Bionano光学图谱及Hi-C染色体构象捕获等技术和平台，旨在为广大合作伙伴提供优质、快捷的基因组转录组测序组装分析服务，同时也为生物演化研究提供助力。

会议内容缤彩纷呈，更多详情请访问：http://asianevo.org/index.html

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Oxford Nanopore官方计划在3月下旬在中国举办的首次Nanopore Day系列活动，未来组在此诚挚邀请您共同参加。

该系列活动由三场研讨会组成，跨越7天，分别在北京，上海和广州三地举办。每场研讨会为期一天，交流形式包括且不限于：

• 分享经验
• 介绍数据和网络
• 参与实际示范

现场除了Oxford Nanopore的员工会为您解答问题，未来组也将与您分享Nanopore组装经验、研发和应用进展。

在Nanopore Day北京会场（3月22日）与上海会场（3月26日），中国三代测序第一人–未来组&希望组CEO汪德鹏将与您分享我们基于Nanopore 技术在科研服务领域和医学应用方向的研究进展与展望。

关于Oxford Nanopore测序

原理简介

（a）motor蛋白牵引DNA至nanopore并解链

（b）DNA的单链通过纳米孔的时候，会对离子的流动造成阻碍。

（c）不同的碱基所造成电流大小的波动，就被记录下来。

应用

随着Nanopore技术的应用日渐成熟，通量和准确率得到极大提升，不断有研究者通过Nanopore数据进行从模式生物到更大基因组的组装，例如1 flowcell测拟南芥基因组^[1]；1 flowcell测果蝇基因组^[2]；~1Gb野生番茄基因组^[3]和~3Gb人类基因组^[4]等等。

近期Nanopore组装动植物基因组盘点

不得不提其中在Nature Biotechnology 上发表的Nanopore超长读长组装人类基因组的研究论文，通过低覆盖深度测序（~30×普通nanopore reads+ ~5× ultra-long reads）即能将基因组Contig N50组装到6.4Mb，填补了参考基因组（GRCh38）中12个gap，是来自单一测序手段得到的迄今最连续的人类的基因组。

Nature Biotechnology丨Nanopore测序组装人类基因组

Nanopore技术不仅通过ultra-long reads 在基因组组装方面有优异的表现，还有另外一个全新突破：Direct RNA测序[5]。不经反转、无须扩增的RNA直接测序能获得全长的链特异性RNA，无测序偏好性，并同时记录碱基修饰，为后续研究基因结构和基因表达，提供新技术新方法。论文也以封面文章形式于2018年2月发表于Nature methods。

Nature methods丨基于Nanopore的direct RNA测序方法测评

未来组自2017年9月开始逐步搭建Nanopore测序平台，于2018年1月17日通过Oxford Nanopore Technologies Limited（牛津纳米孔技术有限公司，ONT）官方认证，获得Nanopore DNA测序认证服务供应商资质。

未来组迄今已完成数十个Nanopore动植物基因组测序组装，“百个Nanopore基因组计划”正如火如荼地进行；后续会陆续购入通量更高的PromethION测序仪，并与牛津纳米孔公司携手推出“1000个中国人基因组结构变异检测计划”，共同开发在生命科学领域的应用。

参考文献

[1] MICHAEL,Todd P., et al. High contiguity Arabidopsis thaliana genome assembly with a single nanopore flow cell. Nature Communications, 2018, 9.1: 541.

[2] MILLER,Danny E., et al. High-quality genome assemblies of 15 Drosophila species generated using Nanopore sequencing.bioRxiv,2018, 267393.

[3] SCHMIDT,Maximilian H.-W., et al. De novo assembly of a new Solanum pennellii accession using nanopore sequencing. The Plant Cell, 2017, 29.10: 2336-2348.

[4] Jain M,Koren S, Miga KH, etal. Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads.Nature Biotechnology, 2018

[5] Garalde D R, Snell E A, Jachimowicz D, et al. Highly parallel direct RNA sequencing on an array of nanopores.Nature Methods,2018.

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2018年伊始，未来组与中国科学院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室达成长期学术交流合作协议，独家冠名赞助该国重2018年“遗传与进化交叉论坛”等一系列学术会议，共同推动中外动物基因组学信息流通，交流合作。

上周，“未来组”遗传与进化交叉论坛2018年第一场报告会在中国科学院昆明动物所西南多样性实验室报告厅成功举办。论坛有幸邀请到重点实验室学术委员会委员桂建芳院士及杨光教授做学术报告，为本论坛拉开帷幕。重点实验室学术委员会委员张克勤教授、昆明动物研究所姚永刚所长、赖仞副所长、重点实验室施鹏主任、毛炳宇副主任等PI以及研究所100余位师生聆听了报告并进行学术交流，论坛由重点实验室副主任焦保卫研究员主持。

报告前，焦保卫研究员简要介绍启动“未来组”遗传与进化交叉论坛的目的、分类等背景情况。桂建芳院士的报告以“从单性生殖银鲫雄性发生与决定机制的发现谈脊椎动物性别演化的多样性与可塑性”为题，完整的呈现了他20多年连续的研究成果。杨光教授以“适应进化驱动鲸类物种形成”为题，分析江豚物种形成时间，并评估其历史种群动态。

关于中国科学院昆明动物所遗传资源与进化国家重点实验室

立足于我国西南和东南亚丰富的生物多样性遗传资源，面向战略生物资源的国家需求和世界科技前沿，在遗传资源多样性的演化与保护、基因与基因组的进化、遗传发育与进化三个重点研究方向上打下坚实的基础。

关于武汉未来组

拥有PacBio SMRT、Oxford Nanopore、BioNano光学图谱及Hi-C染色体构象捕获等技术和平台，长期致力于三代测序在基因组学方向的深度挖掘和应用，解决了动植物基因组、微生物基因组、全长转录组及微生物群体研究等领域的技术瓶颈，推动了基因组学研究的升级换代。

重点实验室与未来组的合作共同致力于突破技术研究瓶颈，推动科技的发展。本次合作是智慧与技术的结合、科技与成果的桥梁。未来组期待与更多伙伴进行多元化的深层次合作交流。

2018年1月13日-17日第26届国际动植物基因组学大会（Plant & Animal Genome Conference, PAG）在美国加州圣地亚哥Town & Country Hotel会议中心举行。欢迎莅临未来组展位424，共同探讨动植物基因组学新成果和进展。

高质量的参考基因组是深入进行物种起源进化和基因功能研究的前提，未来组精选本次会在PAG会议上呈现的基因组研究进展。

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